conda install fastqc trimmomatic(conda可以同时指定两个软件安装) biocondahttps://bioconda.github.io/recipes.html#recipes搜索htseq-count软件 注意要在python2环境下安装htseq,先启动python2环境 source activate python2 conda installhtseq(/一定注意不能再当前环境python3安装,要启动python2环境!我不小心按了y,...
conda install fastqc trimmomatic(conda可以同时指定两个软件安装) biocondahttps://bioconda.github.io/recipes.html#recipes搜索htseq-count软件 注意要在python2环境下安装htseq,先启动python2环境 代码语言:javascript 复制 source activate python2 conda installhtseq(/一定注意不能再当前环境python3安装,要启动python...
$ conda install-y starSTAR--help $ conda install-y hisat2 hisat2-h # 等同于hisat2--help $ conda install-y bowtie2 bowtie2--help $ conda install-y subread featureCounts $ conda install-y htseq htseq-count--help $ conda install-y multiqc multiqc--help $ conda install-y samtools s...
fastqc trim-galore star hisat2 bowtie2 subread htseq multiqc samtools 安装⽅法 参考上⾯conda安装，这⾥直接push代码，就当回顾⼀下~# 配置过镜像后，家⽬录下有⼀个.condarc⽂件，内容如下 $ cat ~/.condarc channels:- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda - ...
htseq-count --help$ conda install -y multiqc multiqc --help$ conda install -y samtools samtools which samtools# /home/qmcui/miniconda2/envs/rna/bin/samtools 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 写在最后的小技巧 ...
安装列表 bwa gatk4 sra-tools fastqc trim-galore star hisat2 bowtie2 subread htseq multiqc samtools 安装方法 参考上面conda安装，这里直接push代码，就当回顾一下~安装每一个软件和调取帮助文档 安装成功出现三个done + 成功调取这个软件的帮助文档=软件安装成功 问题是我怎么知道出来的帮助文档是对的，而不...
$ conda install -y htseq htseq-count --help $ conda install -y multiqc multiqc --help $ conda install -y samtools samtools which samtools # /home/qmcui/miniconda2/envs/rna/bin/samtools 写在最后的小技巧 1 如果我不知道我是不是安装过该软件,怎么办?
conda install fastqc trimmomatic(conda可以同时指定两个软件安装) biocondahttps://bioconda.github.io/recipes.html#recipes搜索htseq-count软件 注意要在python2环境下安装htseq,先启动python2环境 source activate python2 conda installhtseq(/一定注意不能再当前环境python3安装,要启动python2环境!我不小心按了y,...
$ conda install -y htseq htseq-count --help $ conda install -y multiqc multiqc --help $ conda install -y samtools samtools which samtools # /home/qmcui/miniconda2/envs/rna/bin/samtools 写在最后的小技巧 1 如果我不知道我是不是安装过该软件,怎么办?
conda install fastqc trimmomatic(conda可以同时指定两个软件安装) biocondahttps://bioconda.github.io/recipes.html#recipes搜索htseq-count软件 注意要在python2环境下安装htseq,先启动python2环境 source activate python2 conda install htseq(/一定注意不能再当前环境python3安装,要启动python2环境!我不小心按了y...