当然,Comate很乐意为你解答关于conda install命令中-y选项的问题。1. -y选项在conda install命令中的作用 在conda install命令中,-y选项代表“yes”,用于自动确认所有提示,无需用户手动输入。换句话说,当你在安装软件包时使用-y选项,Conda将不会询问你是否继续安装,而是直接进行安装过程。
conda install -y bwa star ##两个常用的比对软件 conda install -y samtools conda install -y bcftools conda install -y vcftools snpEff conda install -y multiqc qualimap featureCounts 每装一个软件都可以使用--help来查看它是否安装成功,如果弹出帮助信息说明安装成功。
添加-y参数跳过确认的步骤conda install -y fastqc=0.11.7 Q3: 安装找不到软件的包 确定一下conda是否能安装我们需要的软件 确定名字是不是输入正确(尤其要注意) 确定好我们要安装的包在conda中的名字 2.3 安装 on Windows Step1 下载 conda 下载地址: ...
conda install -y sra-tools ##可以指定安装版本 ##conda install -y sra-tools=2.10.7 ##安装完成返回3个done,如果有一个文件比较大,终止了,可以重新运行安装命令 # aspera conda install -y aspera-cli -c hcc ascp --help # 可以一次安装多个软件 conda install -y trim-galore hisat2 sub...
-y:跳过确认执行的步骤 conda remove -n yy xx #删除yy环境下的xx软件 -n:参指定环境 9、 conda update xx #升级xx软件 在日常使用较少 10、conda installmamba#在base环境下安装mamba 在base环境中的包在小环境中依然可以调用,因此不需要在每个环境里都安装一遍 ...
莫名其妙的conda管理软件的库文件缺少 默认代码 $ conda install -y -c bioconda salmon Collecting package metadata (current_repodata.json): done Solving environment: done ## Package Plan ## environment location: /home/jmzeng/miniconda3/envs/rna...
conda install -y ipykernel # 每一个conda env都要执行才能再网页中切换 conda install -y jupyter_nbextensions_configurator # 代码补全 jupyter contrib nbextension install --user jupyter nbextensions_configurator enable --user # 代码格式化 pip install yapf ...
conda install --revision -1 conda install --revision 1 tensorflow=2.7 查找包源头:conda show tensorflow anaconda show conda search tensorflow 瘦身与数据源管理:conda clean -p 删除没有用的包 conda clean -t 删除tar包 conda clean -y --all 删除所有安装包及cache conda config --show...
conda install -y sra-tools # 调取该软件的命令的帮助文档,下面两句是重点 prefetch --help fastq-dump --help which prefetch # 运行结果示例如下 # /home/qmcui/miniconda2/envs/rna/bin/prefetch # 可以看到这个命令确实你刚装的,而且存在于rna的小环境内bin的目录下 ...
conda install -y spyder 1. 通常来说不需要再额外安装numpy了。因为spyder中已经预装了numpy,保险起见下面都装了 2)numpy:处理数据,进行科学计算的基础软件包。 conda install -y numpy 1. 3)pandas:用于数据分析的库,提供了高性能的数据结构和数据分析工具。