conda config --add channels https://mirror.nju.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/ 7.北京交通大学 conda config --add channels https://mirror.bjtu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/ conda config --add channels https://mirror.bjtu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/ conda config --add channels https:/...
但后来发现,其还有更多的功能,尤其是其增加了bionconda(https://bioconda.github.io/index.html)通道后,生物信息分析的7925多个软件都可以一键安装了 (具体列表在:https://anaconda.org/bioconda/repo),免去了编译时间浪费和解决库文件安装的问题。另外其最有吸引力的是它的虚拟软件环境概念,可以简单的配置不同Python...
但后来发现,其还有更多的功能,尤其是其增加了bionconda(https://bioconda.github.io/index.html)通道后,生物信息分析的7925多个软件都可以一键安装了 (具体列表在:https://anaconda.org/bioconda/repo),免去了编译时间浪费和解决库文件安装的问题。另外其最有吸引力的是它的虚拟软件环境概念,可以简单的配置不同Python...
conda config --add channels r conda config --add channels bioconda 3.添加国内镜像源 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ conda config --setshow_channel_urlsyes conda config --add channels https://mirrors.tuna...
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/ conda config --setshow_channel_urlsyes 4.创建新环境 1 conda create -n py python=3.5 5.删除新环境 1 conda remove -n py --all 6.重命名环境 1 2
Conda的channel Conda默认的源访问速度有些慢,可以增加国内的源;另外还可以增加几个源,以便于安装更多的软件,尤其是bioconda安装生信类工具。conda-forge通道是Conda社区维护的包含很多不在默认通道里面的通用型软件。r通道是向后兼容性通道,尤其是使用R3.3.1版本时会用到,现在则不需要单独添加了。后加的通道优先级更...
添加Bioconda通道时,注意顺序,给予conda-forge最高优先级,其次是bioconda。如果之前已经添加好了通道,自己在~/.condarc中调整顺序。 conda config --add channels defaults conda config --add channels bioconda conda config --add channels conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/biocondaconda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/menpo 接下来,我们需要设置Conda在搜索时显示新的镜像源地址。输入以下命令: conda config --set show_channel_urls yes 最后,我们可以使用以下命令来...
Bioconda是 Conda的一个 channel,专门用来提供生信软件的 channel,提供有超过7000个的生信软件。 Anaconda 下载安装和使用(Miniconda方法相同) # 下载 Anaconda 清华大学开源软件镜像站 wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/Anaconda3-5.3.1-Linux-x86_64.sh ...
conda config--addchannels https://nanomirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/# 清华通道,最高优先级 conda config--setshow_channel_urls yes 然后看看添加channel的情况 # 显示已有的通道conda config--getchannels 比方说安装R # Create a new conda environment called r,并且在里面安装anaconda...