这里使用了 -c conda-forge 参数来指定从 conda-forge 频道安装,因为 aspera 可能不在默认的 Anaconda 频道中。 执行安装命令: 在命令行中输入上述命令并回车执行。 检查安装是否成功: 安装完成后,你可以通过运行以下命令来检查 aspera 是否已成功安装: bash aspera cp --version 如果安装成功,你应该能看到 asper...
接下来 使用conda安装aspera, 可以高速下载 不同 数据集的fastq文件 ,代码如下: conda create -n download conda activate download conda install -y -c hcc aspera-cli which ascp ## 一定要搞清楚你的软件被conda安装在哪 ls -lh ~/miniconda3/envs/download/etc/asperaweb_id_dsa.openssh 但是在Windows操...
conda create -n sradownload 3.在新环境下安装prefetch和aspera,注意我写的版本!prefetch或者aspera版本太高太低了都不行,一定要合适!这是我试过的能成功的版本 conda install sra-tools=2.9.6 -y conda install -c hcc aspera-cli=3.7.7 4. 安装好了以后,在这个环境下测试 prefetch -t ascp -a "/home...
接下来 使用conda安装aspera, 可以高速下载 不同 数据集的fastq文件 ,代码如下: 代码语言:javascript 复制 conda create-n download conda activate download conda install-y-c hcc aspera-cli which ascp ## 一定要搞清楚你的软件被conda安装在哪 ls-lh~/miniconda3/envs/download/etc/asperaweb_id_dsa.openss...
# 安装成功后需要更新系统环境变量文件 source~/.bashrc 接下来 使用conda安装aspera,新建download子环境,然后在该环境下面安装指定软件 ,就可以高速下载 不同 数据集的fastq文件 ,代码如下: conda create -n download conda activate download conda install -y -c hcc aspera-cli ...
接下来 使用conda安装aspera, 可以高速下载 不同 数据集的fastq文件 ,代码如下: conda create -n download conda activate download conda install -y -c hcc aspera-cli whichascp ## 一定要搞清楚你的软件被conda安装在哪 ls -lh ~/miniconda3/envs/download/etc/asperaweb_id_dsa.openssh ...
6.conda安装/卸载当前channels中不存在的包 anaconda search -t conda xxx #首先搜索包和对应的channel,注意这里是anaconda,而不是conda anaconda show rpetit3/aspera-connect #查看包详情 conda install -c rpetit3 aspera-connect #安装rpetit3 channel中的aspera-connect包 7.更新和卸载包 conda update pack...
可以重新运行安装命令 # aspera conda install -y aspera-cli -c hcc ascp --help #...
6.conda安装/卸载当前channels中不存在的包 1anaconda search -t conda xxx #首先搜索包和对应的channel,注意这里是anaconda,而不是conda2anaconda show rpetit3/aspera-connect #查看包详情3conda install -c rpetit3 aspera-connect #安装rpetit3 channel中的aspera-connect包 ...
Conda的安装与使用 在服务器上使用Linux命令行安装Conda(Conda可以理解类似于应用商店或是mac里的Aapp Store。可以在conda里面安装软件,或者在conda之外安装),使用conda管理小环境和使用conda管理软件,用conda来安装和管理生信软件以及环境比较方便。 conda的安装 ...