在GitHub的包,都是使用 install_github 函数,不过少部分小伙伴可能会失败,因为他们访问GitHub会失败。 另外就是,大家在安装它的时候,它没办法很好的自动解决它自己的依赖问题,所以官网给了其系列依赖包的独立安装方式。 首先是在cran的 代码如下所示: CRANdep <- c("Seurat","reticulate","R.utils","dplyr","...
如果想要安装Github上的R包,需要自己手动在conda创建这个安装包 (要有一个conda的账号) conda skeleton cran <github_url> conda build --R=<my_r_version> r-<lower-case-package-name> conda install -c <my_user_name> <my_package> https://stackoverflow.com/questions/52061664/install-r-package-from...
conda env remove --name myenv # 移除环境 005.安装软件 从conda网页内查找:http://bioconda.github.io/conda-recipe_index.html conda search PACKAGENAME:运行命令查找是否存在 conda 安装R语言以及R包示例 conda info --envs # 查看环境 conda create -n R3.5 # 创建名为R3.5的环境 source activate R3.5...
conda skeleton cran https://github.com/stan-dev/cmdstanr conda-build --R 4.1.1 cmdstanr but now on a different machine on Linux I am getting this error: Preparing transaction: ...working... done Verifying transaction: ...working... done ...
如果没有root权限/sudo权限,个人建议用conda安装,如果基础环境出现缺失的包,可以方便的补全,后期conda命令安装R包也方便。附:conda安装如果有conda环境,几行命令行解决。如果是小白参考该文。# 创建名字为renv的conda虚拟环境(名字随意起) conda create -n renv # 激活环境 conda activate renv # 安装(以R 4.1....
conda install -c conda-forge r-irkernel #在R中注册内核 IRkernel::installspec(user = FALSE) # 备注:权限不够把FALSE改为TURE,表示为当前用户安装 # 备注:启动jupyter后才能切换到R语言Linux使用conda在jupyter上使用R语言步骤:小白教程解释:devtools包可以让您从GitHub安装R包。首先...
2conda安装:conda install r-stringi R包 以 r- 开头 3如果所要下载的R包不在R语言官网上,那它极有可能在Bioconductor或者Github上,可以先登录Bioconductor官网(http://www.bioconductor.org/)搜索相关R包,比如edgeR这个包,搜索到后先查看其相关用途,再进行如下安装: ...
R studio 安装BPST库(github) 解决方法 方法1:使用devtools安装 方法2:下载安装包直接在Rstudio中安装 参考 基础R 库包的安装可参见另一博客-【R库包安装】R库包安装总结:conda、CRAN等。 本博客主要总结我在安装过程中遇到的几个难安装的库包。
R包安装镜像 CRAN和Bioconductor的镜像 安装前现运行这几句话,或把这几句话放在~/.Rprofile或~/.Profile.site文件下 (Windows里面的路径是C:\Program Files\R\R-3.6.1\etc)。 local({r <- getOption("repos") r["CRAN"] <- "http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/" ...
最新的R 3.5 版本特别难安装,而且很多新的包只能在R3.5版本上工作。之前用 make source 的方式总是出错,R3.5的更新依赖太多,需要安装很多依赖软件,废了很大的劲依旧没有成功。 用conda很轻松安装上了R3.5.1版本。安装上了R3.5.1后,我用install.packages的 包, 安装stringi时报错。我又尝试用conda安装结果也很...