首先，访问包含shell、git、Docker、g++、cmake、conda、VSCode等常用命令的代码仓库，获取所需资源。在使用conda时，熟悉常见命令至关重要。在清华源基础上添加相关帮助文档，操作时注意以下几点：1. 创建环境时，可使用-y参数简化输入确认步骤，直接创建环境。2. 激活环境时，显示的环境名位于括号内。3....
针对你提出的命令 conda install -c conda-forge openjdk python=3.8 jpype1=0.7.0 -y,我们可以从以下几个方面进行详细解释: 命令的基本用法: conda install 是用于在 Conda 环境中安装软件包的命令。 参数分析: -c conda-forge:这个参数指定了安装软件包的来源频道为 conda-forge。conda-forge 是一个由社...
首先使用conda create -n NAME [python=3.8] [-y]命令创建一个新的环境,中括号表示可选项,将NAME替换为新环境的名称。 如果输入python=3.8则可以创建一个python版本为3.8的环境,否则默认创建一个与base环境相同python版本的环境。这里强烈建议加上python=3.8这个参数,原因在下一小节中会提到。 如果输入-y参数可以...
Conda下载安装软件指定版本，-y 参数的作用是忽略提示。注：软件都要安装在小环境中，不要安装在 base ...
要指定软件版本，如fastqc 0.11.7，可以添加版本号并使用-y参数跳过确认。Mamba作为Conda的加速版本，提供了更快的下载和并行安装，且在base环境中的包无需重复安装。mamba可用于搜索、安装软件，并显示软件依赖关系。想深入了解，可参考《conda的安装与使用文字教程》和2021公益课的视频教程，它们提供了更...
2. conda clean主要参数 $ conda clean -H usage: conda clean [-h] [-a] [-i] [-l] [-p] [-t] [-f] [-c TEMPFILES [TEMPFILES ...]] [-d] [--json] [-q] [-v] [-y] Remove unused packages and caches. Options: optional arguments:-h, --help Show this help message and ...
3. 根据需要添加其他选项和参数,例如指定软件包列表、源通道等。 4. 等待命令执行完毕,新的环境将被创建在当前工作目录下。 5. 可以使用`source activate <environment_name>`命令来激活新创建的环境。 三、示例 以下是一个简单的示例,展示如何使用`conda create`命令创建一个名为"myenv"的环境,并安装Python和pi...
conda常用参数: conda config 频道地址 conda search 软件名称 conda install 软件名称 conda uninstall 软件名称 conda remove 软件对应包名称 查看当前服务器上安装的所有软件列表: conda list 生信分析配置小环境 配置R语言分析环境 创建R4的cond...
每次创建新环境时,conda会自动安装pip或其他程序。如果您不想在特定环境中安装默认包,请使用--no-default-packages参数: conda create --no-default-packages -n env_name python -y 1. 这将创建一个名为env_name的新环境,而不安装任何默认包。 1.2 生成及从 environment.yml 文件创建环境 ...
conda管理生信软件一文就够 conda下载miniconda安装miniconda配置镜像创建小环境查看小环境进入小环境查找软件安装软件指定软件安装版本更新软件查看已安装软件退出小环境移除小环境其他注意内容pip 安装miniconda安装失败conda网络错误conda 安装软件经常冲突配置镜像出错总结更多组学环境 conda下载 下载系统版本：linux版本：如果是...