4. conda install:该命令用于安装指定的软件包,可以使用-y参数来自动安装所需的依赖项,也可以使用-n参数来指定安装的环境。 5. conda remove:此命令用于移除指定的软件包,可以使用-y参数来自动移除所需的依赖项,也可以使用-n参数来指定移除的环境。 6. conda update:该命令用于更新指定的软件包,可以使用-y参数...
创建独立环境以管理项目，避免base环境冗余，保持环境间的独立性。具体操作包括软件安装，如使用conda安装Blast。搜索可用软件可通过anaconda.org或bioconda.github.io。要指定软件版本，如fastqc 0.11.7，可以添加版本号并使用-y参数跳过确认。Mamba作为Conda的加速版本，提供了更快的下载和并行安装，且在base...
conda install 软件名=版本号 conda install gatk=3.7 conda create -n python2 python=2 # -n: 设置新的环境的名字 # python=2 指定新环境的python的版本,非必须参数 # 这里也可以用一个-y参数,可以直接跳过安装的确认过程。 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 查看已安装软件: conda list 1. conda env li...
安装方法:conda install -y sra-tools trim-galore 参数解释:-y要不要均可,是问你同不同意安装,不要的时候,需要手动输入一个y,自己尝试后就理解了这句话含义;sra-tools trim-galore安装两款软件,默认安装最新版; 注意 trim-galore 一个字都不能错,一个字都不能错,重要的事情说三遍! 指定软件安装版本 con...
conda常用参数: conda config 频道地址 conda search 软件名称 conda install 软件名称 conda uninstall 软件名称 conda remove 软件对应包名称 查看当前服务器上安装的所有软件列表: conda list 生信分析配置小环境 配置R语言分析环境 创建R4的cond...
3. 根据需要添加其他选项和参数,例如指定软件包列表、源通道等。 4. 等待命令执行完毕,新的环境将被创建在当前工作目录下。 5. 可以使用`source activate <environment_name>`命令来激活新创建的环境。 三、示例 以下是一个简单的示例,展示如何使用`conda create`命令创建一个名为"myenv"的环境,并安装Python和pi...
3. conda search:此命令用于搜索指定的软件包,可 以使用-e 参数来指定搜索环境,也可以使用-i 参数来显示 搜索结果的详细信息。 4. conda install:该命令用于安装指定的软件包, 可以使用-y 参数来自动安装所需的依赖项,也可以使用-n 参数来指定安装的环境。 5. conda remove:此命令用于移除指定的软件包,可 ...
conda管理生信软件一文就够 conda下载miniconda安装miniconda配置镜像创建小环境查看小环境进入小环境查找软件安装软件指定软件安装版本更新软件查看已安装软件退出小环境移除小环境其他注意内容pip 安装miniconda安装失败conda网络错误conda 安装软件经常冲突配置镜像出错总结更多组学环境 conda下载 下载系统版本：linux版本：如果是...
针对这一问题,我们在使用 shell 修改容器时,最好添加--no-home参数。 安装qiime1 及其依赖: # source .bashrc . ~/.bashrc # 1 创建新的 conda 环境 qiime1 conda create -n qiime1 python=2.7 conda activate qiime1 # 2 安装matplotlib==1.4.3的时候,出现错误 "The following required packages can ...
5、设置编译参数 cd /home/pi/Downloads/opencv-3.4.0 mkdir build cd build 1. 2. 3. 设置CMAKE参数,时间有点长,十分钟左右吧,下面是一整句话,不要忘了复制后面俩点 cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE=RELEASE -D CMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local -D INSTALL_C_EXAMPLES=ON -D INSTALL_PYTHON_EXAMPLES=...