这里介绍使用ComplexHeatmap直接完成该图。 一 载入R包,数据 使用前面系列推文的TCGA-SKCM的临床数据和随访数据,以及经过lasso模型计算的风险评分结果 。 后台回复“临床”既可获取Expr_phe_cli_riskscore.RData的示例数据。 代码语言:javascript 复制 library(tidyverse)library(ComplexHeatmap)library(ggsci)#颜色librar...
二 临床指标热图可视化 1,直接绘制 使用ComplexHeatmap绘制临床数据注释图 ,重点在于构建一个和临床数据相同列的0矩阵 。 # 提取想展示的临床数据riskScore_cli2 <- riskScore_cli2 %>% select(riskScore:tumor_stage,Age) %>% select(- "age")# 构建列注释块ha=HeatmapAnnotation(df=riskScore_cli2)# 构...
二 临床指标热图可视化 1,直接绘制 使用ComplexHeatmap绘制临床数据注释图 ,重点在于构建一个和临床数据相同列的0矩阵。 # 提取想展示的临床数据riskScore_cli2 <- riskScore_cli2 %>%select(riskScore:tumor_stage,Age) %>%select(-"age")# 构建列注释块ha=HeatmapAnnotation(df=riskScore_cli2)# 构建zero...