raster_device = c(“png”, “jpeg”, “tiff”, “CairoPNG”, “CairoJPEG”, “CairoTIFF”), #raster_device:用于生成光栅图像的图形设备 raster_quality = 2, #raster_quality:设置为大于1的值将改善光栅图像的质量。 raster_device_param = list() #raster_device_param:所选图形设备的其他参数列表...
raster_quality = 2, #raster_quality:设置为大于1的值将改善光栅图像的质量。 raster_device_param = list() #raster_device_param:所选图形设备的其他参数列表。
direction ="vertical", title_position ="topleft"# legend_height = unit(12, "cm") # 热图表达量图例大小),# 顶部注释top_annotation = c(ha_top_1,ha_top_2,ha_top_3),# 合并多个注释对象# 右注释right_annotation = ha_rig,##图像 光栅化转换use_raster =TRUE, raster_quality =5) %>% dra...
raster_quality Ignored now. raster_device_param A list of further parameters for the selected graphic device. For raster image support, please check https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/a-single-heatmap.html#heatmap-as-raster-image . raster_resize_mat Whether resize the matr...
您还可以使用 Heatmap 函数的一些附加参数,例如use_raster、raster_quality、raster_resize_mat、raster_by_magick等。Pes*_*han 2 代码的顺序应该是这样的 png("test.png",width=3.25,height=3.25,units="in",res=1200) Run Code Online (Sandbox Code Playgroud) 您的热图代码 dev.off() Run Code Onli...
热图(Heatmap)作为展示基因表达模式最直观的工具。它经常用在分子生物学文章里(尤其是microarray, RNA-seq相关论文)直观地呈现多样本多个基因的全局表达量变化,和呈现多样本或多基因表达量的聚类关系。绘制复杂热图最好用的是 ComplexHeatmap包,,它提供了灵活、高效、易于定制的方法来绘制多种类型的热图,并支持多种数...
rect_gp=gpar(col=NA),#rect_gp:热图体区矩形的参数,如设置举行边框为白色cell_fun=NULL,#cell_fun:自定义在cell中增加绘图项的函数。7个参数:i(row index,矩阵中的行index), j(column index,矩阵中的列index), x,y(热图体区中中间点的坐标),width,height(cell的宽度和高度),fill(cell的填充颜色)row...
Note if \code{cell_fun} is set, \code{use_raster} is enforced to be \code{FALSE}.} \item{raster_device}{Graphic device which is used to generate the raster image.} \item{raster_quality}{A value larger than 1.} \item{raster_device_param}{A list of further parameters for the ...
在 ComplexHeatmap 中单个热图由热图主体和热图组件组成。热图主体可按行或列进行拆分。热图组件包括标题...
raster_quality = 2, #raster_quality:设置为大于1的值将改善光栅图像的质量。 raster_device_param = list() #raster_device_param:所选图形设备的其他参数列表。