前面介绍过单细胞常见图形的可视化scRNA复现|所见即所得,和Cell学umap,plot1cell完成惊艳的细胞注释umap图,scRNA分析 | 定制 美化FeaturePlot 图,你需要的都在这,scRNA分析| 和SCI学 定制化聚类点图(Dotplot ),含二行代码出图方式,scRNA分析| Seurat堆叠小提琴图不满足?那就ggplot2 堆叠 各种元素,在scRNA分析| D...
Heatmap()函数是绘制热图的基本函数,它会绘制一个热图主体,行名,列名,聚类树和注释。默认的颜色是黄色系的。 代码语言:text 复制 library(ComplexHeatmap) 代码语言:txt 复制 ## 载入需要的程辑包:grid 代码语言:text 复制 ## === ## ComplexHeatmap version 2.8.0 ## Bioconductor page: http://bioconduc...
1写在前面 最近在画热图(heatmap)时,遇到一个问题,就是如果画热图时导入的基因过多,基因名就会重叠在一起,根本没法看,非常影响颜值。😭 这里提供一种基于ComplexHeatmap的解决方案,大家往下看吧。👇 2用到的包 代码语言:javascript 代码运行次数:0 复制 Cloud Studio代码运行 rm(list=ls())library(tidyverse...
scRNA|ComplexHeatmap自定义单细胞转录组celltype-level 热图可视化生信补给站 >《待分类》2023.09.26 北京 关注 前面介绍过单细胞常见图形的可视化scRNA复现|所见即所得,和Cell学umap,plot1cell完成惊艳的细胞注释umap图,scRNA分析 | 定制 美化FeaturePlot 图,你需要的都在这,scRNA分析| 和SCI学 定制化聚类点图(...
前面介绍过单细胞常见图形的可视化scRNA复现|所见即所得,和Cell学umap,plot1cell完成惊艳的细胞注释umap图,scRNA分析 | 定制 美化FeaturePlot 图,你需要的都在这,scRNA分析| 和SCI学 定制化聚类点图(Dotplot ),含二行代码出图方式,scRNA分析| Seurat堆叠小提琴图不满足?那就ggplot2 堆叠 各种元素,在scRNA分析| ...
ComplexHeatmap通过 grid 绘图系统实现,所以需要对基本的 grid 函数有一定了解才能充分利用这个包。 单个热图 先准备示例数据,生成一个随机矩阵,其中列分为三组,行分为三组: 代码语言:javascript 复制 set.seed(123)nr1=4;nr2=8;nr3=6;nr=nr1+nr2+nr3nc1=6;nc2=8;nc3=10;nc=nc1+nc2+nc3mat=cbind...