CNGBdb的科学数据库是基于平台数据构建的多组学应用数据库,覆盖动物、植物、微生物、病原、疾病与健康等研究领域。 植物篇 OneKP: 千种植物数据库 千种植物项目(1KP)是一个国际多学科联盟项目,对超过1000种植物进行了大规模测序研究。数据库基于千种植物数据构建了在线BLAST平台,提供在线BLAST服务。 BiosalineDB:耐...
01/STOmicsDB 时空组学数据库 db.cngb.org/stomics/ 时空组学数据库(STOmicsDB)由深圳国家基因库和深圳华大生命科学研究院共同研发,致力于促进时空组学的数据探索和学术研究。其率先建立时空组数据归档标准,实现时空组学不同层次数据的整合,并形成时空组学数据生态圈,是国际领先的时空组学综合平台。 数据资源 STOmicsD...
Dr.羊 | 一句话了解LettuceDB LettuceDB是截至目前全球最大的生菜种质基因资源数据库。 中国移动 01:35 100% 微信(135) 大佬Dr.羊 君君,CNGBdb有收录和搭建专有科学数据库吗? 有的,目前CNGBdb根据研究方向(植物、动物、微生物、疾病等)及...
国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)是一个为科研社区提供生物大数据共享和应用服务的统一平台。本质是我国组建的一个类似于NCBI存储分子数据的数据库。前身是深圳华大生命科学研究院(原深圳华大基因研究院)的深圳国家基因库。2018年10月在深圳召开第十三届国际基因组学大会(“ICG-13”),开幕式上深圳国家基因库正式发布了...
CNGBdb的科学数据库是基于CNGBdb平台数据,整合其他数据源构建的多组学应用数据库,覆盖动物、植物、微生物、病原、疾病与健康等研究领域。 疾病篇 癌症数据集成与分析平台 DISSECT包含ICGC、TCGA等多个数据库的大量癌症基因组和临床数据,当前已覆盖37个癌种(包括亚型),并将持续更新。除提供数据查询服务之外,DISSECT具备多...
CNGBdb Fish T1K数据库 在CNGBdb的Fish T1K千种鱼转录组数据库,可以查看项目进展,获取转录组数据和样本信息,进行BLAST比对分析。此外,它还分享了鱼类转录组样本制备的方法和标准。库中的数据将随着项目的持续推进不断充实。 04 MilletDB谷子数据库 粟(Setaria italica),北方统称“谷子”,去皮后称“小米”。中国是...
有了样品的下载链接,然后自己使用conda安装aspera,参考 :使用ebi数据库直接下载fastq测序数据, 这个教程来直接下载fastq文件啦。首先使用conda安装aspera,命令如下所示: conda create -n download conda activate download conda install -y -c hcc aspera-cli ...
新冠突发 子库助力科研抗疫 新型冠状病毒引发的肺炎疫情已蔓延至全国各省市。2020年2月12日国际病毒分类委员会(ICTV)宣布新型冠状病毒的正式分类名为SARS-CoV-2,世界卫生组织(WHO)同日宣布,由这一病毒导致的疾病的正式名称为COVID-19。 为加快SARS-CoV-2的研究,CNGBdb同期发布病毒数据库子库:SARS-CoV-2 Database...
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WGVD是一个基于web的开源数据库,汇总了从968个面包小麦及其祖先中收集到的SNPs、indels,以及基于93个小麦全基因组重测数据的SNPs评估的小麦驯化和改良过程中的选择特征。在目前的版本中,WGVD包括7,346,814个SNP和1,044,400个indel,重点关注基因区以及上游/下游区域。