【技术】基于Clustal Omega的多序列比对教程 Clustal Omega是欧洲生物信息研究所(EBI)开发的多序列比对排列工具,现已经完全取代了之前ClustalW的地位。使用该工具不仅能够对DNA或者蛋白质进行多序列比对,并且可以自动生成多种格式或构建进化树等。 网址如下:https://www.ebi.ac.uk/jdispatcher/msa/clustalo ...
1、下载到英文路径并解压完成后,打开“Clustal”文件夹,以管理员身份运行其内的“clustalx-2.1-win.msi”程序文件(本文以ClustalX为例进行安装教程;若需要Clustal O,则打开clustal omega 1.2.2文件夹,运行其内的程序文件;若需要Clustal W,则运行clustalw-2.1-win.msi程序文件),随后按图安装即可。 2、软件界面如...
1、打开下载的安装文件夹,以管理员权限运行对应的安装程序(对于ClustalX,请运行clustalx-2.1-win.msi;对于Clustal O,运行clustal omega 1.2.2内的程序文件;对于Clustal W,运行clustalw-2.1-win.msi),按照安装向导的提示完成安装过程。2、安装完成后,即可在您的电脑上使用Clustal进行多序列比...
Clustal是一款用来对(DNA序列)的软件。可以用来发现特征序列,进行蛋白分类,证明序列间的同源性,帮助预测新序列二级结构与三级结构,确定PCR引物,以及在分子进化分析方面均有很大帮助。Clustal包括Clustalx和Clustalw(前者是图形化界面版本后者是命令界面),是生物信息学常用的多序列比对工具。ClustalOmega 是用Clustal家族的...
•第四步:比对完成,选择保存结果文件的格式 Clustalw的使用(一) Clustalw还提供了命令调用形式的使用方式,方便于批处理过程,下面是一个典型的执行多序列比对的clustalw命令: $./clustalw–infile=dna.fa–type=dna– gapopen=10–gapext=2–output=gcg– outfile=align.gcg-align Clustalw的使用(二) 在线的...