CLIP-Seq,即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(Cross-Linking and Immunoprecipitation High Throughput Sequencing),是一项在全基因组水平揭示RNA与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。 委托科研服务 近年来,该技术广泛应用于miRNA靶标鉴定等研究方向。在动物体内,成熟的单链miRNA与一系列蛋白形成miRNA诱导的沉默复合物(RISC)...
考虑到全转录组测序(RNA-seq)只能揭示混合细胞群体在固定时间点的总体平均水平,因此这种传统策略难以解开深刻的细胞异质性,并不适用于准确解析精子细胞连续发育状态的动态调控过程,而单细胞RNA测序(scRNA-seq)可以使我们从单细胞尺度上追踪不同状态精子细胞的分化轨迹,并回答其如何受到高度有序的动态调控。 5 研究方法 ...
M6A-CLIP-seq将CLIP技术和高通量测序技术结合起来,用于研究RNA甲基化修饰m6A(N6-methyladenosine)的分布以及其与蛋白质的相互作用。m6A是一种常见的RNA内部化学修饰,在真核生物的转录和剪接中具有重要的功能。M6A-CLIP-seq可以帮助研究人员鉴定与m6A修饰相关的蛋白质,并确定它们与RNA的相互作用的位点和序列。 M6A-CLIP...
通量测序,通过高通量研究RNA结合蛋白(RBP)在体内与众多RNA靶标的结合模式,并揭示其在一 些重要生物学过程中的功能,是一项在全基因组水平揭示RNA分子与RBP相互作用的革命性技术。也 被应用到miRNA靶标鉴定、lncRNA生物学功能研究等工作中。 CLIP-seq的应用范围:(1)绘制全基因组范围的RNA和RBP相互作用图谱,解析“Ar...
CLIP-seq (crosslinking-immunprecipitationandhigh-throughput sequencing)即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序,可以高通量研究RNA结合蛋白在体内与众多RNA靶标的结合模式,并揭示其在一些重要生物学过程中的功能,是一项在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。
技术路线:构建动物模型,确认表型,进行单细胞测序,结合clip实验,分析下游靶标,验证机制。研究背景:精子分化经历多个步骤,转录从活跃转变为惰性。传统策略难以准确解析精子细胞连续发育状态的动态调控过程,而单细胞RNA测序(scRNA-seq)为追踪不同状态精子细胞的分化轨迹提供了可能。研究方法:构建DDX43...
m6a-clip-seq测序原理 M6A-Clip-Seq是一种用于确定RNA分子上的N6-甲基腺嘌呤(m6A)残基和与它们结合的蛋白质的技术。它结合了CLIP-Seq技术和甲基化内切酶的特性,以分析m6A修饰并分析m6A信号复合物。 。 CLIP-Seq用于检测RNA分子上的结合蛋白质,涉及结合反应的共价交联,接着通过RNA分子的酶切和纯化来进行CLIP-Seq...
CLIP-seq (crosslinking-immunprecipitationandhigh-throughput sequencing)即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序,可以高通量研究RNA结合蛋白在体内与众多RNA靶标的结合模式,并揭示其在一些重要生物学过程中的功能,是一项在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。
RNA结合蛋白富集测序 RIP-Seq/CLIP-Seq服务 CLIP-seq (crosslinking-immunprecipitationandhigh-throughput sequencing)即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序,可以高通量研究RNA结合蛋白在体内与众多RNA靶标的结合模式,并揭示其在一些重要生物学过程中的功能,是一项在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术...
CLIP-seq (crosslinking-immunprecipitationandhigh-throughput sequencing)即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序,可以高通量研究RNA结合蛋白在体内与众多RNA靶标的结合模式,并揭示其在一些重要生物学过程中的功能,是一项在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。