最后放一张line plot的示例,在下图中,除去染色体外,包括3个line plot; 最内圈的line plot有3种填充色,背景色也有3种,另外两圈的line plot中,其axes的定义就是使用了position的用法,可以看到其轴线非常少,只有2,3条;最内圈的line plot的轴线则采用spacing的用法,其轴线非常多,而且均匀分布 完整代码如下 代码语言...
{g()track.num<-11;RCircos.Link.Plot(RCircos.Link.Data,track.num,TRUE);data(RCircos.Ribbon.Data);RCircos.Ribbon.Plot(ribbon.data=RCircos.Ribbon.Data,track.num=11,by.chromosome=FALSE,twist=FALSE)}h()保存为PDF 这个需要具体设置,因为circos图占画布跟其它图不太一样 out.file<-"RCircosDemoHum...
library(tidyverse)library(ggplot2)library(org.Hs.eg.db)library(GOplot)library(clusterProfiler) 5.结果文件 注:该结果图片为绘制的GO富集分析结果Circos圈图,用不同的颜色来表示不同的term,用不同的颜色连线来表示基因在所属的term,以及用渐变色来表示基因所对应的logFC值。 关注公众号,回复“代码”可以免费领...
修改这个文件里面的内容：
circos 中的pattern是做什么用的 在官网提供的配置文件示例中,经常会见到pattern这个参数。这个参数的作用和fill_color类似,都用于指定填充的样式,只不过fill_color使用颜色进行填充,pattern则用点和线进行填充。 在hisograms,heatmap,links这3种block 中,可以使用pattern参数,指定填充的样式,用法如下:...