下面是Circle-seq测序的原理步骤: DNA环形化:首先,通过PCR扩增或酶切将待测序的DNA片段转化为环状DNA。这可以通过连接两个末端序列的引物或使用限制性内切酶切割并连接两个末端来实现。 DNA扩增:环状DNA被扩增成线性DNA。这一步可以利用常规PCR方法进行。 DNA环形化再生:再次通过连接两个末端序列的引物或使用限制性...
图博基因Circle-seq测序,采用包括柱纯化等多种方式去除基因组DNA,利用酶消化去除线粒体DNA和线性DNA, 运用滚环扩增放大信号,达到高效率的富集和纯化环状DNA效果。最后利用NGS测序和生信分析识别eccDNA。 数据分析 Circle-seq数据分析主要是利用fastqc软件对原始数据进行质量评估,使用BWA软件将原始数据比对到参考基因组,使用...
Circle-Seq的技术原理是,首先富集得到样品中的DNA,随后利用外切酶去除线性基因组DNA,得到Circular DNA,对Circular DNA循环扩增后进行超声打断、建库测序及测序数据的分析。 了解了Circle-Seq的技术原理,下面再来看下达澈生物测试数据的结果吧~ Circular DNA富集质检 以SK-BE2细胞为样品,在外切酶处理线性DNA后,以HBB基因...
Circle-seq又称为环状DNA测序,是eccDNA检测利器。(图博基因eccDNA测序与eccDNA合成服务)。是基于质粒提取、酶切消化和高通量测序技术,将裂解细胞通过柱纯化、去除线性DNA、滚环式扩增三大步骤进行eccDNA的富集,结合高通量测序获取eccDNA的序列信息的技术。 Circle-seq可以高通量地对各种物种样本当中检测样品中的所有eccDNA,...
Circle-seq又称为环状DNA测序,是eccDNA检测利器。(图博基因eccDNA测序与eccDNA合成服务)。是基于质粒提取、酶切消化和高通量测序技术,将裂解细胞通过柱纯化、去除线性DNA、滚环式扩增三大步骤进行eccDNA的富集,结合高通量测序获取eccDNA的序列信息的技术。 Circle-seq可以高通量地对各种物种样本当中检测样品中的所有eccDNA,...