,之后再分别用dimer和-0.05收敛的CI-NEB进行计算;在使用CI-NEB的时候一直难以收敛并且过程中的某个...
MatCloud+平台的【过渡态搜索CI-NEB】组件的计算结果中,呈现可视化的迁移路径、能量势垒及每个插点的构型。【过渡态搜索CI-NEB】组件会将能量势垒对应的结构输出到【过渡态优化Dimer】组件中,后者会优化得到更准确的过渡态结构。 图2 过渡态搜索CI-NEB计算结果 3) MatCloud+与文献的对比 参考文献: [1] Olsson E,...
首先,通过搭建工作流,结合VASP和过渡态计算组件,设置参数并提交计算。MatCloud+的【过渡态搜索CI-NEB】组件提供了可视化的路径、能量数据,以及每个插点的详细构型,进一步通过【过渡态优化Dimer】组件优化得到准确的过渡态结构。对比传统方法,CI-NEB在处理像Li在石墨烯表面的吸附和迁移这类问题时,显示出...
2,可以试试用主要虚频作为MODECAR来跑个dimer,从经验上来讲这样跑个dimer小的虚频都可以消除掉。dimer...
DIMER | 这是过渡态搜索的另一种重要方法。原理:定义了由两个点R1和R2组成的一个二聚体(可理解为一个哑铃)。这两个点的中间点为R,其受力为(F1+F2)/2,总能量为(E1+E2)/2。这个方法的每一步包括平移Dimer和旋转Dimer两步。步骤:1-优化初末态结构 2-准备过渡态初猜结构POSCAR,方法:可根据初末态能量差...
用VASP的CI-NEB计算过渡态太慢了,各位有什么解决办法吗?看到有人说先粗算,用IOPT=3,EDIFFG调大...
挖坑留念。。。最近算了一个空位吸附Pt的迁移势垒,直接使用vtst自带的线性插值,跑了接近200步都没收敛...
2左右,然后用neb2dim.pl,把能量最高的点单独拿出来跑dimer。这样找过渡态成功率很高。
计算过渡态的问题。我想先用CINEB方法 计算几步,然后选一个插点结构作为初猜,进行dimer运算。
可以先跑cineb,然后再以ts附近的片段跑dimer http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/index.html ...