2. Chothia Numbering Scheme:基于环拓扑定义,结构 1987年,Chothia和Lesk引入了一种基于结构的抗体可变区编号方案。他们比对了抗体可变区的晶体结构,明确了形成CDR的环结构,并修正了CDRL1和CDRH1中插入点的位置编号,使其更符合拓扑位置(图1)【和可视化的结构区域的对应更加准确】【32】。此外,他们将重链和轻链的CDR...
Kabat Numbering和Eu Numbering是两回事。 Eu是指上个世纪60年代末(1968)Gerald M.Edelman(因抗体序列结构方面的研究得过诺贝尔奖)等人分离纯化得到一个人IgG1免疫球蛋白,命名为Eu,并测定了其氨基酸序列并遍了号,就被沿用为Eu Numbering,现在已经很少使用了。 Kabat Numbering应该是在Eu Numbering的基础上结合更多的I...
然而,类似于Kabat编号方案,可以通过定义新的插入点来优化该系统。 2.3 Martin编号方案( Martin Numbering Scheme ) 在2008年发表的一项研究中,Martin等人重点关注非常规长度的不同框架区域的结构对齐: 他们强调了大多数序列和结构中不存在的残基,因此作者将这些定义为缺失位置。 通过分析序列和结构,他们还提出了从位置H...
Kabat Numbering和Eu Numbering是两回事。 Eu是指上个世纪60年代末(1968)Gerald M.Edelman(因抗体序列结构方面的研究得过诺贝尔奖)等人分离纯化得到一个人IgG1免疫球蛋白,命名为Eu,并测定了其氨基酸序列并遍了号,就被沿用为Eu Numbering,现在已经很少使用了。 Kabat Numbering应该是在Eu Numbering的基础上结合更多的I...