CHIRP(ChromatinIsolation by RNA Purification)是一种检测与RNA结合的DNA和蛋白质相互作用的方法,可同时分析lncRNA/circRNA 、蛋白及DNA三者互作关系。利用ChIRP-seq技术可用于在全基因范围内定位lncRNA/circRNA的结合位点和可能结合的其他RNA分子,是揭示lncRNA/circRNA 生物学
ChIRP-seq(Chromatin Isolation by RNA Purification followed by sequencing)技术是一种通过RNA引导的染色质沉淀和测序方法,用于高通量检测染色质中的长链非编码RNA(lncRNA)与其相互作用的基因组分布。 实验…
基于CHIRP技术,数谱生物提供CHRIP DNA-Seq服务将富集的靶标RNA结合的DNA进行测序。 技术优势 探针结合内源的靶标RNA分子,特异性高; 富集在细胞内与靶标RNA原位结合的DNA,反映细胞内真实的RNA-DNA互作状态; 可以与CHIRP –MS同时进行试验,探索与靶标RNA共同互作的DNA和蛋白质服务...
CHIRP-Seq(Chromatin Isolation by RNA Purification)是一种检测与RNA绑定的DNA和蛋白的高通量测序方法。方法是通过设计生物素或链霉亲和素探针,把目标RNA拉下来以后,与其共同作用的DNA染色体片段就会附在到磁珠上,最后把染色体片段做高通量测序,这样会得到该RNA能够结合到在基因组的哪些区域,但由于蛋白测序技术不够成熟...
CHIRP(ChromatinIsolation by RNA Purification)是一种检测与RNA结合的DNA和蛋白质相互作用的方法,可同时分析lncRNA/circRNA 、蛋白及DNA三者互作关系。利用ChIRP-seq技术可用于在全基因范围内定位lncRNA/circRNA的结合位点和可能结合的其他RNA分子,是揭示lncRNA/circRNA 生物学机制的关键实验手段。
ChIRP-seq ChIRP(Chromatin Isolation by RNA Purification)是⼀种在全基因组范围内检测与RNA结合的DNA和蛋⽩的⾼通量检测⽅法，可以同时分析lncRNA、结合蛋⽩和DNA的互作关系，该技术是获取lncRNA调控靶基因的有效途径。ChIRP⽅法是通过设计与⽬标RNA序列反向互补的⽣物素探针，其与链霉亲和素结合，与...
ChIRP-seq 不需要对染色质相互作用中所涉及的lncRNA结合域预先了解,在整个目标RNA上平铺寡聚核苷酸,使所有潜在的杂交位点都被充分利用,确保捕获所有的RNA片段。 利用ChIRP probe可用于在全基因范围内定位lncRNA的结合位点以及可能结合的其他RNA分子(Chu C et al. 2011);结合蛋白质组学技术,可以鉴定lncRNA在染色质水...
ChIRP( Chromatin Isolation by RNA Purification)[1]是一种同时分析lncRNA/circRNA[2]、蛋白及DNA三者互作关系的实验方法。利用ChIRP-seq技术可用于在全基因范围内定位lncRNA/circRNA的结合位点和可能结合的其他RNA分子,是揭示位于细胞核内lncRNA/circRNA 生物学机制的关键实验手段。
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