横向代表基因组坐标,纵向代表ChIP-seq的信号强度, 伙伴们在文章中可能看到过有的峰图不只是向上的,还有向下的,水平线上方的峰代表正方向的,下方的代表互补链,有的一上一下有些错位, 是测序造成的。 转录因子的结合和组蛋白修饰,二者的...
chipseq什么是..该实验方式能够获取单个样品中所有表达的蛋白质因子及与之发生互作的表层基因组DNA样本,从而获得丰富的元件蛋白与其调控的靶标分子及其空间分布的信息^[2]^
分享到: 染色质免疫沉淀-测序 分类: 生物学词汇|查看相关文献(pubmed)|免费全文文献 详细解释: 以下为句子列表: 英文: Processing and analysis of ChIP-seq data 中文: 下一代测序中ChIP-seq数据的处理与分析更详细...
首先是ChIP-Seq分析的前言介绍部分: 1:了解ChIP-seq的实验流程 2:继续了解ChIP-Seq 3:关于ChIP-Seq的实验对照与偏差来源 4:ChIP-Seq的实验设计补充 5:ChIP-Seq数据库及实战数据介绍 然后开始实战部分: 6:ChIP-Seq计算资源准备与实战数据下载 7:ChIP-Seq数据质控和过滤 ...
首先是ChIP-Seq分析的前言介绍部分: 1:了解ChIP-seq的实验流程 2:继续了解ChIP-Seq 3:关于ChIP-Seq的实验对照与偏差来源 4:ChIP-Seq的实验设计补充 5:ChIP-Seq数据库及实战数据介绍 然后开始实战部分: 6:ChIP-Seq计算资源准备与实战数据下载 7:ChIP-Seq数据质控和过滤 ...
ATAC-seq:通过motif分析可分析谁调控了目的基因,获得潜在调控因子 实验验证,或chip-seq验证。l ATAC-...
ChIP-seq数据的质量控制 数据相关度的统计 对于有重复的数据,数据相关度的统计可以作为质量控制的手段。 结合位点的检测 利用国际主流的MACS工具来确定结合位点的位置,即call peak。 结合位点在基因附近的特征分析 统计在基因转录起始位点,转录终止位点,上下游区域附近的平均强度 ...
箭头表示转录起点和方向。话说连这都没学过就已经开始看ATAC/chip-seq会不会有点混乱啊?