ChIP-seq(Chromatin Immunoprecipitation Sequencing)是一种高通量测序技术,用于研究蛋白质-DNA 相互作用和基因组中的染色质修饰。它结合了免疫沉淀和测序技术,广泛应用于基因组学和表观遗传学研究。 chip-seq的分析流程包括一下步骤: 1. ChIP 实验步骤 1.1 交联和裂解 交联:使用化学交联剂(如甲醛)将蛋白质与 DNA ...
答案是ChIP-seq（染色质免疫共沉淀结合下一代测序技术），没错，小远今天将要给大家介绍的就是与染色质免疫共沉淀相关的内容，染色质免疫共沉淀实验除了可以研究转录因子与启动子的结合之外，还能做什么实验呢？想要一探究竟，就跟着小远一起往下看吧！01染色质免疫共沉淀简介 蛋白质-DNA相互作用的全基因组图谱和表...
ChIP-Seq(染色质免疫共沉淀测序)是一种研究体内蛋白质与DNA相互作用的技术。该技术结合了染色质免疫共沉淀(ChIP)和第二代测序技术,以在全基因组范围内检测与特定蛋白质(如转录因子、组蛋白等)相互作用的DNA区段。 实验步骤主要包括: 1.交联:在生理状态下,将细胞内的DNA与蛋白质进行交联,以固定它们的相互作用状态...
ChIP-seq是基于抗体的免疫沉淀实验,因此它的数据质量好坏直接取决于抗体的质量和特异性。 另外,针对同一蛋白的不同抗体,可能会识别不同的表位(尤其是单克隆抗体)。因此建议针对同一感兴趣蛋白测试不同的抗体,通过Western blot检测knock-down前后的差异帮助选择。
Chip-seq是一种广泛应用在生物学研究中的技术,它能够帮助研究人员识别蛋白质与DNA结合的位置,从而揭示基因表达的调控机制。实验原理主要包括DNA修饰、DNA片段化、DNA抗体结合和测序等步骤。 Chip-seq实验首先需要将细胞或组织中的DNA进行交联,使得蛋白质与DNA结合形成复合物。接着,采用酶将DNA修饰,例如甲基化等,以便将...
Q1什么是ChIP-Seq? ChIP-Seq即染色质免疫共沉淀-高通量测序,是指通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集与目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化和文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序,是目前在全基因组水平研究蛋白结合靶DNA序列的重要手段,为转录因子、组蛋白修饰等表观遗传学的研究提供有效方法。
ChIP-seq服务流程 客户在线下单——订单/实验材料确认——细胞培养——1%甲醛交联蛋白-DNA复合物——超声打断蛋白-DNA复合物——抗体沉淀蛋白-DNA复合物——解交联并纯化DNA片段——文库构建——Hiseq上机测序、数据质控 其中文库构建流程：（1）DNA片段末端修复；（2）3’端加A碱基；（3）连接测序接头；（4）PCR...
染色质免疫沉淀后测序(ChIP seq)是一种针对DNA结合蛋白、组蛋白修饰或核小体的全基因组分析技术。由于...
Chip-seq(Chromatin Immunoprecipitation Sequencing)是一种用于研究染色质上蛋白质与DNA相互作用的技术。在进行Chip-seq实验之前,需要进行一系列的质控步骤,以确保实验结果的准确性和可靠性。下面将详细介绍chipseq实验质控的步骤。 1.样本制备和处理: 在进行chipseq实验之前,首先需要准备和处理样本。这包括细胞培养、组织...