ChIP-seq是染色质免疫沉淀测序的缩写。从根本上说,ChIP-seq 是对与正在研究的 DNA 结合蛋白共沉淀的基因组 DNA 片段进行测序。以这种方式最常研究的 DNA 结合蛋白是转录因子(例如,p53 或 NFκB)、染色质修饰酶(例如,p300、组蛋白去乙酰化酶)、与基因组 DNA 相互作用的修饰组蛋白(例如,组蛋白 3 三甲基化赖氨...
ChIP-Seq即染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)与二代测序技术的结合,通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集与目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化和文库构建,然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。能够在全基因组水平研究蛋白结合靶DNA序列,特别是在转录因子、组蛋白修饰等表观遗传学的...
不过Chip - seq就像一个聪明的小裁缝。它先用一种特殊的针法(交联剂)把这两根线(蛋白质和DNA)的连接固定住,然后把这个大毛线球(染色质)剪成一个个小线团。再用一个只对特定线(目标蛋白)有感觉的小夹子(抗体)把和这根线相连的小线团(DNA片段)夹出来。最后看看这些小线团是什么样子的,就能知道这两根线的...
ChIP-seq其实是个组合拳,包括染色质免疫共沉淀(ChIP)和二代测序(seq)。简单来说,ChIP是用来研究蛋白质和DNA之间相互作用的技术,而ChIP-seq则是通过二代测序来分析这些相互作用。这个技术主要有两大类应用:转录因子(TF)的ChIP-seq和组蛋白(Histone)的ChIP-seq。 转录因子的ChIP-seq 转录因子是那些能结合到基因上...
ChIP-seq服务流程 客户在线下单——订单/实验材料确认——细胞培养——1%甲醛交联蛋白-DNA复合物——超声打断蛋白-DNA复合物——抗体沉淀蛋白-DNA复合物——解交联并纯化DNA片段——文库构建——Hiseq上机测序、数据质控 其中文库构建流程：（1）DNA片段末端修复；（2）3’端加A碱基；（3）连接测序接头；（4）PCR...
1.1什么是Chip-seqChIP-seq技术结合染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)与高通量测序,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。 1.2产品功能ChIP-seq技术是将ChIP与高通量二代测序结合,从基因组范围内检测组蛋白、转录因子等蛋白质结合的DNA...
CHIPseq是一种用于研究基因组与蛋白质之间相互作用的生物信息学分析方法。通过将免疫沉淀技术与高通量测序相结合,CHIPseq能够检测到蛋白质与DNA之间的相互作用,从而揭示基因组中潜在的调控机制。CHIPseq9是CHIPseq的一个变种,使用了更为灵敏的第九代测序技术,能够在更短的时间内产生更高质量的数据。二、CHIPseq9数据...
ChIP-seq是一种结合了染色质免疫共沉淀技术和二代测序的分析方法，主要用于研究蛋白质与DNA的相互作用。ChIP-seq包括两大类应用：TF ChIP和Histone ChIP。其原理流程为：1. Crosslinking：通过甲醛固定目标蛋白与染色质，确保结合稳定性。2. 细胞裂解提取核DNA，进行超声打断或核酸酶消化，形成DNA片段。3...