ChIP-Seq:用于在全基因组范围中研究DNA结合蛋白(相互反应)、组蛋白修饰(表观遗传标记)和核小体的技术,研究这三个主题可有助于了解基因之间的相互调控以及染色体的功能结构。ChIP-Seq实验原理:示意图为Fig.1和Fig.2. 在生理状态下,把细胞内的DNA与蛋白质交联(Crosslink)后裂解细胞,分离染色体,通过超声或酶处理将...
ChIP-seq是基于抗体的免疫沉淀实验，因此它的数据质量好坏直接取决于抗体的质量和特异性。另外，针对同一...
ChIP指染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP),seq 指的是二代测序,那么ChIP-seq实际上也就是染色质免疫共沉淀+二代测序的一个过程。ChIP用来确定蛋白质与DNA相互作用情况,所以目前的ChIP-Seq 研究主要包括两大类应用——TF ChIP 和Histone ChIP: ChIP-seq的原理流程: 1、Crosslinking:使用甲醛将...
染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)技术原理 蛋白质与DNA相互识别是基因转录调控的关键,也是启动基因转录的前提。ChIP技术是在全基因组范围内检测DNA与蛋白质体内相互作用的一种标准方法[1],该技术由Orlando等[2]于1997年创立,最初用于组蛋白修饰的研...
图1 ChIP-seq路线图 问题二：ChIP-seq特殊样本细菌、真菌或者植物根、茎类样本项目推进中可能存在的卡...
ChIP-seq的原理+流程: 1、Crosslinking:使用甲醛将目标蛋白与染色质交联固定起来(细胞具有通透性,生理状态下,转录因子和DNA的结合不稳定,所以需要用甲醛处理稳定结合,防止在后续打断DNA时lose binding。如果是研究核小体的位置和组蛋白修饰的位置,Histone的结合本身很稳定,可以免去Crosslinking这一步); ...
一、染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)技术原理 蛋白质与DNA相互识别是基因转录调控的关键,也是启动基因转录的前提。ChIP技术是在全基因组范围内检测DNA与蛋白质体内相互作用的一种标准方法[1],该技术由Orlando等[2]于1997年创立,最初用于组蛋白修饰的研究,后来被广泛应用到转录因子作用位点的研究中[3]。
ChIP-seq的原理+流程: 1、Crosslinking:使用甲醛将目标蛋白与染色质交联固定起来(细胞具有通透性,生理状态下,转录因子和DNA的结合不稳定,所以需要用甲醛处理稳定结合,防止在后续打断DNA时lose binding。如果是研究核小体的位置和组蛋白修饰的位置,His...