因为ChIP-qPCR使用的模板就是来自genomic DNA,是很多“碎小”的原始基因组DNA,最常见是基因的启动子区域或者转录起始位点TSS上下游的2kb左右的区域(可能会包含外显子区域),所以这时候使用在线qPCR引物设计软件或是仪器自带引物设计软件的时候,一定要清晰的明确这一点,要把这个模板区域的序列信息“告知”仪器或是软件,...
当没有合适的目的蛋白（X）抗体时，可以通过表达融合了标签的目的蛋白，例如Flag，利用Flag标签做免疫沉淀。即细胞过表达Flag-X，经裂解后与anti-Flag Beads孵育，目的蛋白与Flag融合的蛋白与Beads结合，与目的蛋白融合Flag的融合蛋白互作的DNA就会“共沉淀”到Beads上，再经洗涤、洗脱后做qPCR或NGS测序。图 染色质免...
因此，研究蛋白质与DNA在特定器官组织或特定胁迫条件下的相互作用是阐明真核生物基因表达调控机制的基本途径。染色质免疫沉淀技术（Chromatin immunoprecipitation assay, ChIP）是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法，主要包括ChIP-qPCR和ChIP-seq两种；其中ChIP-qPCR用来验证与目标蛋白结合的已知DNA片段，ChIP-seq用...
lChIP-qPCR用于检测通过蛋白特异性免疫沉淀富集得到的特定 DNA 序列的相对数量。ChIP-sequence能对蛋白-DNA 相互作用和组蛋白修饰进行全基因组范围内的分析。两大技术路线：因为：甲醛交联后的染色质对限制性内切酶、MNase及DNase I高度抵抗，不易被酶切断。通常需要使用超声波来物理打断染色质。所以：根据实验者研究的...
验证：通过qPCR对ChIP结果进行验证。高通量测序：准备好ChIP后的DNA样品用于ChIP-seq建库，质检及测序。图3 染色质免疫沉淀ChIP-seq/qPCR实验流程。图4 带标签的染色质免疫共沉淀流程图。04ChIP-seq的应用 上面对ChIP-seq的一些基本概念以及实验流程进行了介绍，那么介绍完这个实验之后，这个实验除了本文开头提到的寻找...
验证:通过qPCR对ChIP结果进行验证。 高通量测序:准备好ChIP后的DNA样品用于ChIP-seq建库,质检及测序。 图3 染色质免疫沉淀ChIP-seq/qPCR实验流程。 图4 带标签的染色质免疫共沉淀流程图。 04 ChIP-seq的应用 上面对ChIP-seq的一些基本概念以及实验流程进行了介绍,那么介绍完这个实验之后,这个实验除了本文开头提到的...
图 ChIP实验技术流程图（Giaimo et al., 2017）。服务流程 服务流程 客户在线下单——订单/实验材料确认——细胞固定——超声破碎——抗体孵育——与靶蛋白-DNA复合物结合——ProteinA结合抗体-靶蛋白-DNA复合物——复合物沉淀——洗脱——解交联——DNA纯化——鉴定（可选ChIP-qPCR、ChIP-seq、ChIP-PCR、ChIP-...
验证:通过qPCR对ChIP结果进行验证。 高通量测序:准备好ChIP后的DNA样品用于ChIP-seq建库,质检及测序。 图3 染色质免疫沉淀ChIP-seq/qPCR实验流程。 图4 带标签的染色质免疫共沉淀流程图。 04 ChIP-seq的应用 上面对ChIP-seq的一些基本概念以及实验流程进行了介绍,那么介绍完这个实验之后,这个实验除了本文开头提到的...
ChIP-PCR/qPCR技术流程 染色质免疫共沉淀技术ChIP-Qpcr/pcr流程图 ChIP-PCR/qPCR技术概述 ChIP是一种在活体内研究DNA和蛋白质相互作用的方法,广泛用于多领域中染色质相关蛋白的研 究。相比其他DNA 与蛋白相互作用的研究方法,ChIP 的突出优势在于通过检测蛋白与DNA的结合, ...
验证:通过qPCR对ChIP结果进行验证。 高通量测序:准备好ChIP后的DNA样品用于ChIP-seq建库,质检及测序。 图3 染色质免疫沉淀ChIP-seq/qPCR实验流程。 图4 带标签的染色质免疫共沉淀流程图。 04ChIP-seq的应用 上面对ChIP-seq的一些基本概念以及实验流程进行了介绍,那么介绍完这个实验之后,这个实验除了本文开头提到的寻...