qPCR可以对目的片段进行定量分析。通过对目的序列的扩增,并与Input、阳性对照和阴性对照的量对比,就可以证明目的蛋白是否与预想的DNA序列发生了相互作用。 ChIP-Seq 是将回收纯化的DNA进行建库测序,用于发现目的蛋白潜在结合的DNA序列。 好多小伙伴ChI...
ChIP-qPCR用于检测通过蛋白特异性免疫沉淀富集得到的特定 DNA 序列的相对数量。ChIP-sequence能对蛋白-DNA 相互作用和组蛋白修饰进行全基因组范围内的分析。 两大技术路线:因为:甲醛交联后的染色质对限制性内切酶、MNase及DNase I高度抵抗,不易被酶切断。通常需要使用超声波来物理打断染色质。 所以:根据实验者研究的目...
qPCR测定文库浓度 Agilent 2100测定文库片段大小 1.3. 生物信息分析流程 将测序结果与参考基因组比对,比对上唯一位置的序列用于后续标准信息分析及个性化分析。信息分析流程如下: 此节内容为Chip-seq基本流程介绍,包括 实验流程 建库流程 分析流程 2. 数据结果及生物信息分析 2.1. ChIP Sequencing 文库质检结果 文库片段...
最近打算做EMSA, 想知道大家都用什么试剂盒呢？有人用invitrogen公司的Electrophoretic Mobility-Shift Assay...
ChIP-Seq显示IRF6结合区域跨越PPARγ基因的3280bp,峰值出现转录起始位点下游的2244 bp(图3A)。PPAR信号通路显示PPARγ靶基因显著性上调,特别是脂肪生成相关基因(图3C)。然后qPCR进行 mRNA检测,及蛋白水平检测等,综合这些结果发现,IRF6功能是转录调控Pparγ基因,并且抑制 Irf6 足够增加PPARγ基因和它的靶mRNA和蛋白表...
qPCR可以对目的片段进行定量分析。通过对目的序列的扩增,并与Input、阳性对照和阴性对照的量对比,就可以证明目的蛋白是否与预想的DNA序列发生了相互作用。 ChIP-Seq 是将回收纯化的DNA进行建库测序,用于发现目的蛋白潜在结合的DNA序列。 好多小伙伴ChIP实验做的晕头转向,尤其是新手做实验两眼一抹黑、无从下手,如果能有...
qPCR测定文库浓度 Agilent 2100测定文库片段大小 1.3. 生物信息分析流程 将测序结果与参考基因组比对,比对上唯一位置的序列用于后续标准信息分析及个性化分析。信息分析流程如下: 此节内容为Chip-seq基本流程介绍,包括 实验流程 建库流程 分析流程 2. 数据结果及生物信息分析 ...
ChIP-Seq显示IRF6结合区域跨越PPARγ基因的3280bp,峰值出现转录起始位点下游的2244 bp(图3A)。PPAR信号通路显示PPARγ靶基因显著性上调,特别是脂肪生成相关基因(图3C)。然后qPCR进行 mRNA检测,及蛋白水平检测等,综合这些结果发现,IRF6功能是转录调控Pparγ基因,并且抑制 Irf6 足够增加PPARγ基因和它的靶mRNA和蛋白表...
qPCR测定文库浓度 Agilent 2100测定文库片段大小 1.3. 生物信息分析流程 将测序结果与参考基因组比对,比对上唯一位置的序列用于后续标准信息分析及个性化分析。信息分析流程如下: 此节内容为Chip-seq基本流程介绍,包括 实验流程 建库流程 分析流程 2. 数据结果及生物信息分析 2.1. ChIP Sequencing 文库质检结果 文库片段...