1. Mapped reads 现在我们有了 BAM 文件的索引，我们可以使用 idxstatsBam() 函数检索和绘制映射读取的...
近年来发展起来的ChIP-chip技术将基因组DNA芯片(chip)技术与染色质免疫沉淀技术(ChIP)相结合,为研究目的蛋白与整个基因组相互作用提供了可能。ChIP-chip 技术通过标记染色质免疫沉淀富集的DNA片段,和另一个被标记不同探针的对照组样品一...
原文地址:ChIP的qPCR如何定量分析?作者:专注ChIP/IP/WB实验 ChIP-qPCR data needs to be normalized for sources of variability,including amount of chromatin, efficiency of immunoprecipitation,and DNA recovery. Here we discuss two common methods used to normalize ChIP-qPCRdata—the Percent Input Method and...
与input相关的ChIP-qPCR数据包括ChIP的背景水平和input染色质的标准化。建议ChIP 实验重复，尽可能将结果...