使用默认对齐参数的叠合不成功。当蛋白质关系非常遥远时,切换到低数量的BLOSUM矩阵和/或增加二级结构评分的比例可能是有用的。 例如,以121p作为参考结构,点击Include secondary structure score(30%)右侧的Show parameters按钮,滑动下方的滑块调整至.90,将二级结构权重提高到90%;并在Alignment algorithm右侧的下拉菜单中...