chiapet原理 ChIA-PET(Chromatin Interaction Analysis with Paired-EndTag sequencing)是一种双结束测序(paired-end tag sequencing)方法,它可以精确地测定DNA片段之间的物理互作关系和距离。用ChIA-PET分析可以确定基因组特定区域间基因组间相互作用(inter-chromosomal interactions)或跨基因组互作(intra-chromosomal...
ChIA-PET(chromatin interaction analysis by paired-end tag sequencing)在染色质构象捕获技术的建库基础上,结合了ChIP-seq 和PET 的测序方法,特异性地寻找整个基因组范围内相互作用的DNA片段。 交联-片段化-抗体结合 通过与ChIP-seq 相同的办法,ChIA-PET可以使用特异性的蛋白抗体,去选择性测序和目标蛋白交联在一起...
连接PET是确定蛋白质因子结合位点的基础。通过 其中,染色质内的间连接PET所占比例最大,是 图 1 PET测序技术基本原理[1] 《生命的化学》2011年31卷1期 · 154 · ● CHEMISTRY OF LIFE 2011,31(1) 图2 ChIA-PET技术基本原理 用于确定结合位点间相互作用的重要依据。它是两 表明,蛋白质因子通过使染色质成...
ChIA-PET 技术已用于确定人乳腺腺癌细胞内雌激素受体 a的结合位点之间的相互作用。随着更多蛋白质因子的发现及其抗 体的应用,该技术可实时捕获全基因组范围内参与复制、转录过程的蛋白质因子结合位点以及结合位点间的相互 作用,这对于阐明基因调控和疾病发生机制具有重大意义。 关键词:ChIA-PET技术;全基因组;染色质...