CGGA数据库中的临床数据可以与基因组数据(如基因表达、突变和甲基化模式)结合使用,以进行更深入的生物信息学分析和研究。例如,研究人员可以探索特定基因表达模式与患者生存率之间的关系,或者分析不同治疗策略对患者预后的影响。 通过提供这些临床数据,CGGA使得研究人员能够在更广泛的生物学和临床背景下解释基因组数据,从而...
9. 数据量过大 10. 技术支持和社区帮助 CGGA数据库打不开的原因可能包括:服务器维护、网络连接问题、浏览器兼容性、账号权限不足、数据迁移。服务器维护是最常见的原因之一,可能是由于网站正在进行定期的维护和更新,导致暂时无法访问。服务器维护期间,网站可能会进行一些安全更新、性能优化或者是修复一些已知的问题。
这个数据库是2021年由江涛教授作为发起人和创建者启动的。(cgga.org.cn/)。该数据库旨在通过基因组学技术结合生物信息学分析方法,全面绘制中国人群的脑胶质瘤基因组图谱,从中探寻脑胶质瘤发生、发展过程中的驱动因子以及关键信号通路,为脑胶质瘤的分子分型和药物靶点研发提供指导和脑胶质瘤精准医学全链条的发展奠定基础...
CGGA数据库包含了来自中国人群的2000余例脑胶质瘤样本的多维功能组学数据,其包括全外显子组测序、转录组测序和表观遗传组学数据等。CGGA数据库当前已实现多维功能基因组学数据共享,通过丰富多样的数据分析功能和用户友好的可视化分析工具,为全球众多国家和地区科研人员提供重要的...
CGGA[http://www.cgga.org.cn/]:Chinese Glioma Genome Atlas,中国脑胶质瘤基因组图谱计划,发布2000例中国脑胶质瘤样本...
近日,由北京市神经外科研究所、首都医科大学附属北京天坛医院江涛教授团队建立的中国脑胶质瘤基因组图谱数据库(CGGA)进行了大幅度更新。目前该数据库涉及近2000例不同组织病理分类、不同WHO恶性度分级、原发/复发中国人群的脑胶质瘤的基因组学数据涵盖全外显测序数据(286例)、mRNA芯片检测数据(301例)、mRNA测序数据(...
1、CGGA数据库挖掘 -生信自学网 主要内容 简介 数据下载(基因表达、临床数据) 批次矫正 生存分析过滤 独立预后分析过滤 ROC过滤 临床相关性过滤 生存曲线 独立预后分析 ROC曲线 临床相关性分析 GSEA富集分析 共表达分析和圈图绘制 CGGA数据库 CGGA,中国脑胶质瘤基因组图谱计划(Chinese Glioma Genome Atlas)数据库发布...
我们常说以史为鉴,用过去看昭示自己,又常说站在巨人的肩膀上看世界,用前人做好的铺垫完成我们要完成的事业,这门CGGA数据库挖掘(仅限胶质瘤研究)课程也是如此,站在老师的肩膀上去学东西,我们能走得更快更稳些。 另外也给大家推荐一些我经常学习的内容: ...
神外前沿讯,近日,CGGA数据库发布了2,000例中国脑胶质瘤样本的功能基因组学数据,其中涉及不同组织病理分类,不同WHO恶性度分级、原发/复发配对样本,功能组学数据涵盖全外显测序 (286例)、mRNA芯片 (301例)及其测序 (1018例)、microRNA芯片 (198例)、以及DNA甲基化芯片 (159例)。
CGGA数据库包括2000例中国脑胶质瘤样本的功能基因组学数据,功能组学数据涵盖全外显测序 (286例)、mRNA芯片(301例)及其测序(1018例)、microRNA芯片(198例)、以及DNA甲基化芯片(159例)。这个数据库中包含了详尽的临床数据,包括患者性别、年龄、放疗和化疗情况、完整随访数据、组织病理分类、不同WHO恶性度分级、原发/...