如果你还记得之前的cBioportal推文,那么这个答案就是肯定的,这个包便是cgdsr。还记得它吗? cBioportal 上面我们可以看到,cBioportal提供了R语言和Matlab两个软件的接口,那么今天,我们学习一下,基于cBioportal开发出的R包cgdsr. 所有工具包的学习,首要的第一步便是在你的工作环境下,安装相应的工具包,毕竟巧妇难为无米之...
使用R包cgdsr来下载TCGA的数据生信菜鸟团 前面我讲到TCGA的数据可以在5个组织机构可以获取,他们都提供了类似的接口来供用户下载数据 每个接口都有使用教程,比如 非常详细 有的还专门写了软件接口: 或者写了R的接口: 接下来我们要讲的就是cbioportal网站提供的一个R接口,非常好用,只需记住4个函数即可 只需熟记get...
只要是ngs数据文献 愿意遵守这个cBioPortal规则,就可以把其突变信息和表达量信息以及病人临床信息,按照固定的格式整理好,并且上传到cBioPortal网站,就可以使用cBioPortal的网页工具去探索它。 我们这里不纠结这个网页工具的用法了,那个很容易摸索,我们介绍生信工程师喜欢的编程语言来操作这个网页工具,就是 cgdsr: R-Based AP...
cgdsr包:R语言工具包,可以下载TCGA数据。 DT包:data.table包,简称DT包,是R语言中的数据可视化工具包。DT包可以将Javascript中的方法运用到R中,也能将矩阵或者数据表在网页中可视化为表格,以及其它的一些功能。 > setwd("C:/Users/YLAB/Documents/R/win-library/4.1/") > install.packages("R.methodsS3_1.8.1...
cgdsr.Rproj README LGPL-3.0 license About The package provides a basic set of R functions for querying the Cancer Genomics Data Server (CGDS), hosted by the Computational Biology Center at Memorial-Sloan-Kettering Cancer Center (MSKCC).
TCGA 的数据可以在5个组织机构获取,它们都提供了类似的接口来供用户下载数据。 cgdsR 包是cBioPortal 提供的R包 http://www.cbioportal.org/rmatlab cgds -- Cancer genomic Data Service 安装cgdsR >install.packages("cgdsR", repos="http://cran.us.r-project.org") ...
哎哟!!!//@Mercury_阿凉:[泪]双向奔赴的爱//@0林深时雾起0:宝宝[可怜]//@想听永恒孤独的Jerry:宝宝真好//@魔法少女杰尔马66:哈哈哈哈哈哈哈哈哈//@成为小狗:灯牌和闪光灯像什么地下组织接头对暗号。商务车商务...
人物简介: 一、吴梦琪担任职务:吴梦琪目前担任兰山区元宇宙电子经营部法定代表人;二、吴梦琪投资情况:目前吴梦琪投资兰山区元宇宙电子经营部最终收益股份为0%;老板履历 图文概览商业履历 任职全景图 投资、任职的关联公司 商业关系图 一图看清商业版图
最适合居住的美国州是加利福尼亚州。该州因其宜人的气候、丰富的文化活动、就业机会以及高质量的生活而被视为居住的理想之地。以下是具体的理由:1. 宜人的气候:加利福尼亚州拥有多样的气候类型,从北部的凉爽湿润到南部的温暖干燥,满足不同居民的气候偏好。2. 丰富的就业机会:作为美国经济的重要中心,加利福尼亚...
西红柿和鹌鹑蛋可以一起吃,而且两者之间并没有冲突,不会发生食物上的化学反应,所以是可以一起搭配食用的,西红柿中含有丰富的维生素C以及番茄红素,以及糖分和微量元素,能够给人体提供一定的营养物质,而鹌鹑蛋中含有丰富的蛋白质以及脂质,能够给人体提供丰富的营养物质,两者之间一起食用,有利于起到互补的作用。小孩子...