该方法包括:获取受试者生物样本并从中提取cfDNA样本;(2)从cfDNA样本中取出两份等量的cfDNA样本,分别加入第一容器和第二容器中进行PCR扩增,检测生物样本中ESR1基因是否发生突变;其中,第一容器中包括对ESR1基因E380Q特异性的引物对、对ESR1基因Y537C特异性的引物对、对ESR1基因Y537N特异性的引物对、对ESR1基因Y537S...
(1)构建的cfDNA基因文库与提前构建好的filler DNA混合,获得cfDNA基因 文库与filler DNA混合物; (3)将5‑甲基胞嘧啶抗体与步骤(2)得到的cfDNA基因文库与filler DNA混合物进行免 疫共沉淀反应,对混合物中的DNA甲基化片段进行捕获,然后经纯化得到捕获后产物片段; (4)对步骤(3)所得的产物片段进行扩增富集,然后...
1.一种检测受检者外周血中的cfDNA突变信息的方法,其特征在于,包括:对外周血样品进行DNA提取,获取外周血样品中的cfDNA;基于cfDNA进行文库构建,得到cfDNA文库;基于所述cfDNA文库进行杂交捕获,得到目标序列;对所述目标序列进行基因测序,得到测序数据;基于所述测序数据进行数据分析,得到突变信息; 其中,基于cfDNA进行文库构建...
1.一种基于cfDNA碱基突变频率分布检测肝癌特异突变的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤: 步骤1.从已提取的受试者的血浆中提取cfDNA; 步骤2.对步骤1提取的cfDNA的进行末端修复并在cfDNA的3’端添加A碱基,在处理后的cfDNA两端连接测序带有分子标签UMI的截短型Y型接头,得到连接产物,并对连接产物进行磁珠纯化,用含有...
摘要 本发明公开了一种检测受检者外周血中的cfDNA突变信息的方法,包括对外周血样品进行DNA提取,获取外周血样品中的cfDNA;基于cfDNA进行文库构建,得到cfDNA文库;基于所述cfDNA文库进行杂交捕获,得到目标序列;对所述目标序列进行基因测序,得到测序数据;基于所述测序数据进行数据分析,得到突变信息。本发明提供的方法能够用于...
专利摘要显示,本说明书实施例提供一种基于cfDNA检测ESR1基因突变的方法和试剂盒,该方法包括:获取受试者生物样本并从中提取cfDNA样本;(2)从cfDNA样本中取出两份等量的cfDNA样本,分别加入第一容器和第二容器中进行PCR扩增,检测生物样本中ESR1基因是否发生突变;其中,第一容器中包括对ESR1基因E380Q特异性的引物对、对ESR1...
1.一种cfDNA甲基化突变的检测方法,其特征在于,主要包括以下步骤:(1)提取全血游离DNA,经过末端修复、末端加“A”、连接illumina测序平台专用index测序接头,构建cfDNA基因文库;(2)将步骤(1)构建的cfDNA基因文库与提前构建好的filler DNA混合,获得cfDNA基因文库与filler DNA混合物;(3)将5‑甲基胞嘧啶抗体与步骤(2)...
本发明公开了一种检测受检者外周血中的cfDNA突变信息的方法,包括:对外周血样品进行DNA提取,获取外周血样品中的cfDNA;基于cfDNA进行文库构建,得到cfDNA文库;基于所述cfDNA文库进行杂交捕获,得到目标序列;对所述目标序列进行基因测序,得到测序数据;基于所述测序数据进行数据分析,得到突变信息。本发明提供的方法能够用于检测...
通过收集肿瘤患者的手术前血液样本与手术后血液样本,分别提取cfDNA进行高通量UMI测序。经过高精度的序列处理与合并后,分别对每个血液样本进行突变检测。鉴定突变后,使用所有体细胞突变在手术前后两个时间点的频率变化对不同类型基因突变进行分群。然后对筛选到的肿瘤来源突变进行整合,筛选出的肿瘤来源特异突变可以进一步用于...
专利权项:1.一种基于cfDNA碱基突变频率分布检测肝癌特异突变的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:步骤1.从已提取的受试者的血浆中提取cfDNA;步骤2.对步骤1提取的cfDNA的进行末端修复并在cfDNA的3’端添加A碱基,在处理后的cfDNA两端连接测序带有分子标签UMI的截短型Y型接头,得到连接产物,并对连接产物进行磁珠纯化...