甲基化的检测共有两种方法,重亚硫酸盐法及酶转化法。而相较于酶转化法,重亚硫酸盐法会导致DNA链的断裂损坏,并使转化后文库的GC占比缺失,而通过酶转化法得到的数据更为精确,遂本项目选用酶转化法进行DNA甲基化深度测试。 在实现测试...
启动子、增强子、CTCF结合位点的cfDNA甲基化测序方法——cfDNA-RBS，实现了高灵敏度和样本复用，使其具有...
由于细胞分裂时会释放出游离的DNA片段(cfDNA)进入循环系统,因此cfDNA可能反映体细胞组织的突变特征。 传统上,从癌症组织全基因组测序(WGS)中提取体细胞突变特征,然后对匹配的肿瘤和正常样本进行中等深度的突变检测。但在低覆盖率的WGS数据中,体细胞和胚系突变很可能仅通过等位基因片段无法区分,这就使得那些基于每个位点...
目前,此类DNA的研究已经扩展到了NIPT应用领域中。 研究方法:对27例阳性校准样本和58例阴性血浆cfDNA样本进行鸟枪法测序(MPSS)检测,分析测序深度与病毒载量的相关性。随后,在人群队列中进行HCMV病毒检测的验证分析,此队列包含538例妊娠女性,其中有36例进行了2次测序,因此共计574个孕妇血浆cfDNA数据。 该研究中采用...
使用上述cfDNA末端修复试剂进行适用于MGI测序平台的cfDNA测序文库的构建方法,包括如下步骤: 1)在末端修复缓冲液试剂中用末端修复酶组合物处理cfDNA以产生5’端磷酸化且3’端加A的cfDNA; 2)末端修复产物接头连接反应,在末端修复体系中直接加入MGI接头、T4连接酶及T4连接Buffer,进行接头连接; 3)接头连接产物进行磁珠纯...
专利名称 cfDNA末端修复的酶组合物、缓冲液试剂和测序文库的构建方法 申请号 2020101949141 申请日期 2020-03-19 公布/公告号 CN111378632B 公布/公告日期 2021-03-19 发明人 余丽萍 专利申请人 江苏康为世纪生物科技股份有限公司 专利代理人 王园园 专利代理机构 北京惠智天成知识产权代理事务所(特殊普通合伙)...
所述的酶Ⅱ为T4多聚核苷酸激酶(T4 Polynucleotide Kinase,简称T4 PNK).本发明还提供了一种cfDNA末端修复缓冲液试剂.本发明还提供了使用上述的试剂进行cfDNA末端修复和构建cfDNA测序文库的方法.本发明具有如下技术效果:本发明的试剂酶用量少,成本低,且具有意想不到的更高的修复效率,适用于样本量较低的cfDNA进行末端...
DNA测序方法 , 汇报人: 目录/目录 01 点击此处添加 目录标题 04 DNA测序的技 术方法 02 DNA测序技术 概述 05 DNA测序的实 验操作流程 03 DNA测序的基 本原理 06 DNA测序的应 用前景和挑战 01 添加章节标题 02 DNA测序技术概述 DNA测序的定义 DNA测序是一种生物技术,用于确定DNA序列 DNA测序技术包括多种...
8月15日,MD安德森癌症研究中心的Nicholas Navin课题组在Cell上发表了文章Archival single-cell genomics reveals persistent subclones during DCIS progression,报道了第一个能对FFPE组织进行高通量单细胞DNA测序的方法:Arc-well(archive nanowell...
DNA测序结果拼接方法 回到NCBI首页，选择BLAST，下拉，点击TBLASTN 粘贴下载的序列 填写你想拼接的序 列。。。进行blast 选择一个序列，进入 将序列下载下来 点击blast 点击 粘贴序列选择otherS 填写想比对的物种 选择序列 运用Dnaman 序列--序列拼接 输入两个待拼接的序列的保存地址 待拼接序列显示区 点击 运用PBIL...