(1) Figure 1:CellOracle 方法的整体框架 研究首先以小鼠造血谱系为测试系统,验证 CellOracle 能够准确预测已知 TF(如 Spi1 和 Gata1)在血液细胞分化中的作用。 结果表明,CellOracle 预测的 TF 扰动后细胞分化方向与实验数据高度一致,证明其在生物学应用中的可行性。 (2) Figure 2:CellOracle 方法的实验验证 通...
CellOracle使用链式法则完美地计算目标基因的偏导数,模拟从转录因子到直接和间接靶基因的信号传播。 CellOracle 可用于大规模生成有关转录因子对细胞命运决策机制影响的假说。过去,由于伦理因素限制,基因扰动实验无法在人体中实现。而CellOracle的出现,使得转录因子对人体细胞命运决策的机制性研究有了进⼀步的突破。从发育...
第一步:准备base-GRN tutorial:https://morris-lab.github.io/CellOracle.documentation/tutorials/base_grn.html https://morris-lab.github.io/CellOracle.documentation/notebooks/01_ATAC-seq_data_processing/option1_scATAC-seq_data_analysis_with_cicero/01_atacdata_analysis_with_cicero_and_monocle3.html 新...
oceanandshoreIP属地: 湖北 0.582024.10.23 13:18:14字数 54阅读 65 GitHub - morris-lab/CellOracle: This is the alpha version of the CellOracle package Nature | AI学习基因调控网络预测细胞分化类型 - 知乎 ©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者 ...
要查看Oracle Exadata Cell的磁盘型号,你可以按照以下步骤进行操作: 登录到Oracle Exadata Cell的控制节点: 首先,你需要通过SSH或其他远程登录方式访问Oracle Exadata Cell的控制节点。确保你有适当的权限来执行这些操作。 打开CellCLI命令行界面: 在控制节点上,打开CellCLI(Cell Command Line Interface)命令行界面。CellCLI...
Oracle数据库在逻辑上由表空间(tablespace),段(segment),区段(extent),块(block)分层组成。 Database 数据库由一个或多个表空间组成。 Tablesapce 表空间物理上由一个或多个数据文件组成。这些文件可以是文件系统中的文件、原始分区、ASM管理的数据库文件或集群文件系统上的文件。表空间逻辑上由至少一个段组成。
关于Oracle数据库中的等待事件cell Physical IO Interconnect Bytes 该等待事件也会出现在非Exadata平台下,在如下的mos文章中, "cell Physical IO Interconnect Bytes" Wait Event In A Non-Exadata Server (Doc ID 2079379.1) 有如下的说明: At present, "cell physical IO interconnect bytes" is nothing more tha...
2023年2月8日,华盛顿大学Samantha Morris团队在Nature发表了一种新型的细胞命运预测模型CellOracle。该模型通过计算模拟基因调控网络扰动筛查实现了大尺度系统性转录因子-细胞命运调控的机制研究。CellOracle首先建立⼀个基于单细胞染色质可及性的表冠遗传基因调控网络。具体来说,该算法首先通过scATAC-seq数据中cis-regulato...
[root@cell ~]# vi /etc/grub.conf 将default=0修改为default=1 ，然后重启。因为默认Oracle Linux...
oracle.adf.view.faces.bi.component.pivotTable Class CellImagejava.lang.Object oracle.adf.view.faces.bi.component.pivotTable.CellImage Deprecated. Use <dvt:dataCell> with child tag <af:image> or <af:commandImageLink> instead@Deprecated public class ...