今天演示一下 Linux 下非 root 用户 Conda 安装生物信息 R 软件包 CellMix,CellMix 是一款 9 年前就停止更新的老旧生物信息 R 软件包,但是却有人仍然需要使用它。由于年代久远,官网上的安装方法在现在的较新的 R 版本环境下已经失效,给安装带来相当的难度。本文的演示环
如果网络不行,可能导致在 R 环境中其中依赖包 stringi 不能正常安装,那么我们可以预先用 conda 安装上这个包,如下: conda install -c conda-forge r-stringi 我用上面腾讯云的网络是不需要这步的。 另外,在 R 环境下编译安装依赖包 curl 时可能会报告 libcurl 无法找到,从而编译安装失败,我们同样可以预先用 cond...
cell-specific expression: what is the expression profile of each cell type? which genes are differently expressed in each cell types between groups of samples? Install CellMix package source('http://bioconductor.org/biocLite.R')biocLite("CellMix",siteRepos="http://web.cbio.uct.ac.za/~renaud/C...