Cell BLAST 简介 Cell BLAST 是由北京大学高歌研究员实验室 (gao-lab.org/) 开发的一个基于深度对抗学习模型的单细胞转录组数据检索和注释的新方法。相关的研究成果于 2020 年发表在 Nature Communications 期刊上面。 Cell BLAST 还具备高质量注释的单细胞转录组参考数据库 ACA Reference Panels,为有效利用现有数据...
Cell BLAST官网 Cell BLAST是什么? 一个自带高质量参考数据库的scRNA-seq数据检索/注释工具 克服批次效应 Cell BLAST使用对抗自编码器进行转录组数据降维,利用对抗学习策略来消除数据集间的批次效应。 Cell BLAST使用的生成模型的结构 自带高质量注释参考库:ACA 通过收集大量已发表的单细胞转录组数据,研究团队建立了一...
The birth of death, 30 years ago Gerry Melino Richard A. Knight Yufang Shi Editorial10 Apr 2024 Mechanisms of regulated cell death during plant infection by the rice blast fungusMagnaporthe oryzae Matthew R. Wengler Nicholas J. Talbot
诺奖得主Jennifer Doudna教授最近在Cell期刊上发表了她团队的最新研究成果,介绍了一项关于Cas9基因编辑酶的重大突破。 通过利用基因工程技术改造Cas9的WED结构域,她的团队成功将一种来源于嗜热脂肪地芽孢杆菌(Geobacillus stearothermophilus)的Cas9酶(GeoCas9)的基因编辑活性提高了超过100倍。这项改造不仅极大增强了特定Cas9酶...
6月29日,我校水稻研究所陈学伟教授团队在Cell杂志(2016年SCI收录影响因子达30.41)发表了题为“A Natural Allele of a Transcription Factor in Rice Confers Broad-Spectrum Blast Resistance(一个转录因子的天然变异赋予水稻对稻瘟病的广谱抗性)”的研究论文(我校为通讯单位、水稻所陈学伟教授为通讯作者,李伟滔副研究...
BLAST、Clustal Omega等工具介绍(包含实践示范:如何使用这些工具) 多序列比对MSA的重要性 基于数学或深度学习的蛋白质序列相似度分析方法(包含实践示范:序列特征提取方法示范) 1.2 深度学习在蛋白质序列分类中的应用 自动特征提取 蛋白质家族分类 蛋白质功能分类 2. 蛋白质大语言模型介绍(重点) 2.1 语言模型介绍 什么...
事情的起因是,6月29日,全球顶级学术期刊《Cell》在线发布了以四川农业大学为通讯单位、陈学伟为通讯作者、李伟滔为第一作者的论文“A natural allele of a transcription factor in rice confers broad-spectrum blast resistance”(一个转录因子的天然变异赋...
6月29日,我所陈学伟团队在《CELL》上发表了题为“A natural allele of a transcription factor in rice confers broad-spectrum blast resistance”(一个转录因子的天然变异赋予水稻对稻瘟病的广谱抗性)的研究论文。该论文发现水稻的天然变异位点——编码C2H2类转录因子的基因Bsr-d1的启动子,其作用是可以有效提高对...
A sensor kinase controls turgor-driven plant infection by the rice blast fungus 期刊：Nature 年份：2019年 物种：水稻 疾病：稻瘟病 样本：组织、细胞 组学技术：磷酸化蛋白质组学、转录组、基因组 研究内容：稻瘟病对全球的粮食安全是一个巨大的威胁，尽管目前对稻瘟病菌的入侵方式已基本明确，但是在附着胞...
LINE1基因座覆盖率最高的BLAST结果被选为最佳匹配,并根据它们在L1.4序列上的比对位置进行特征进行注释。对照UCSC RepeatMasker中注释的人类基因组(Hg38)中存在的所有132个LINE1亚家族的基因组分布,使用Fisher's exact test对新鉴定的461个含LINE1转录本的LINE1亚家族进行富集分析。最终在461个含LINE1的转录本中搜索...