研究者使用金属同位素对类器官进行了原位Barcode标记后,对不同的类器官培养进行混样和抗体染色。实验用到包括抗体和Barcode等在内的共53个通道,分析了390个不同类器官培养的约六百万单细胞。质谱流式不仅印证了上述单细胞测序结果,更对培养基中每个配体(WNT3A、EGF...
在此分析中,仅考虑了对特定亚细胞区室的注释。这排除了所有完全未分类的蛋白,"大型蛋白复合物"注释在Itzhak等人和Schessner等人中的注释,以及SubCellBarcode中的"分泌、未分类"注释。◉ 此外,不考虑蛋白异构体:对于共享相同基因名的蛋白,只考虑一个注释。没有明确基因名的蛋白(即非规范蛋白产物)未被包括。◉ G...
YigZ不仅在遗传上是定殖的必要条件,其表达增强亦是定殖能力提升的充分原因。 图3.作者开发并应用了一套基于DNA条形码标记(barcode)的定量竞争系统,能够在同一宿主个体中同时追踪多株大肠杆菌的体内定殖表现,从而高效评估多个CF在实验室背景菌...
为了能同时追踪多个菌株在同一只小鼠体内的定植情况,他们还巧妙地为每个MG1655菌株都打上了一个独特的DNA条形码(Genomic Barcode),这样通过高通量测序就能精确计算每种菌株的相对丰度。 他们将这6种携带不同质粒的、带有条码的MG1655菌株混合在一起,喂给抗生素预处理的小鼠。然后在接下来的几天里,收集粪便样本,提取DN...
Frome cell: Protein Barcodes Enable High-Dimensional Single-Cell CRISPR Screens https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.09.022 3.CRISPR-Cas引物采集复合物单分子表征 CRISPR-Cas系统赋予针对病毒的适应性免疫。在病毒注射后,Cas1-Cas2将病毒基因组的区段(间隔区)整合到CRISPR基因座中。在I型CRISPR-Cas系统中...
每个Barcode都是特殊设计的，Barcode带有一段每个细胞特异的UMI，用来标记细胞，也可以说每个Barcode代表一...
High-Spatial-Resolution Multi-Omics Sequencing via Deterministic Barcoding in Tissue,翻译过来就是“基于组织内确定性条码的高空间分辨率多OMICS测序”。看起来像是在介绍一种新的技术,我们再看看In Brief:DBiT-seq is a microfluidic-based method to deliver barcodes to the surface of a tissue slide to allo...
athese items can be printed with text or barcode that duplicates information encoded in AAA or adds to it これらの項目は情報をAAAで符号化される重複させるか、またはそれに加えるテキストとまたはバー・コード印刷することができる[translate] ...
单细胞 RNA-seq (scRNA-seq) 被广泛用于解决细胞异质性问题。随着公共 scRNA-seq 数据的快速积累,有效且高效的利用现有数据来注释新数据至关重要。 Cell BLAST 过去十年的技术进步形成了大规模单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 数据的快速积累。类似于生物序列分析,现有的注释(例如细胞类型和细胞分化潜力)可用于通过细...
【12】2023年10月17日,西湖实验室的王寿文研究员联合波士顿儿童医院的李莉博士和Fernando Camargo教授在Cell 杂志发表题为“A mouse model with high clonal barcode diversity for joint lineage, transcriptomic, and epigenomic profiling in single cells”的研究论文,开发了新一代谱系追踪小鼠DARLIN,以及多组学谱系追...