-CDOCKER_ENERGY和-CDOCKER_INTERACTION_ENERGY理论上计算值应该都是正值,但是计算结果显示-CDOCKER_ENERGY是负值,可能是因为分子内能过高,建议使用“Minimize Ligands”模块对小分子结构进行优化,释放一部分分子内能,然后再进行对接计算,以提高-CDOCKER_ENERGY值。同时也可以观察蛋白结合口袋是否能容纳小分子配体,或采用...
但是计算结果显示-CDOCKER ENERGY是负值，可能是因为分子内能过高，建议使用“Minimize Ligands"模块对小分子...
energy为负值，也就是对接能量为正值 技术说可以优化后再做对接 可是优化后没有什么变化。。。
我遇到个问题就是,-cdocker_energy为负值,也就是对接能量为正值技术说可以优化后再做对接可是优化后没有什么变化。。。
- **CDOCKER Energy**：总能量，包括了配体内部的能量和与受体的相互作用能量。能量为负值表示整个体系...
CADD 谢谢,不好意思,昨天比较急,忘了附加金币了。下次一定补上。太感谢了。 see_uok 我遇到个问题 就是,-cdocker_energy为负值,也就是对接能量为正值 技术说可以优化后再做对接 可是优化后没有什么变化。。。 chemozhang 帖子真精彩! 已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集》,猜你喜欢...
做过CDOCKER后，-DOCKER_ENERGY的值一直不是很好，但是晶体结构的对接结果却和原来很相近，RMSD的值是0...
energy为负值，也就是对接能量为正值 技术说可以优化后再做对接 可是优化后没有什么变化。。。