8个序列包含了完整编码框,可判断为全长基因。结论:成功构建了铁皮石斛茎组织均一化全长cDNA文库,为满足铁皮石斛代谢途径等功能基因筛选和基因信息研究奠定了基础。 标签:铁皮石斛;均一化;cDNA文库;序列分析 铁皮石斛Dendrobium officinale Kimura et Migo是兰科Orchidaceae石斛属多年生草本植物,具有独特的药用价值,为我国...
c)cDNA的代表性差异显示分析法 d)差异消减展示等方法这些方法在新基因的发现方面都各有其独特的优势,可寻找出一些差异表达序列,但这些差异表达序列大部分情况都是不完整的基因。第5页/共73页1.2cDNA文库的产生 由于以前技术的缺点,目前,比较可行而且应用较多的方法主要是cDNA文库的筛选。一方面cDNA文库只代表一定时期...
西洋参cDNA文库构建及表达序列标签(EST)分析
(二) cDNA序列的同源性比较 克隆的cDNA是否为新基因?它与其他已发现的基因序列有何异同?这一切可通过相应的软件(如Blast、FastA、PIMA、MAP等)对网上多个DNA序列数据库(Gene Bank、EMBL和DDBJ等)中已登陆的序列进行搜索、比较,了解序列间的相似程度,以判断该片断是新基因还是某基因家族的成员。有些基因的核苷酸顺序...
一、背景简介二、cDNA文库构建原理三、cDNA文库的应用四、EST序列分析五、参考文献 CollegeofLifeScienceandBiotechnology cDNA文库构建及EST序列分析背景简介 ——黄显军 CollegeofLifeScienceandBiotechnology cDNA基因文库：某生物某一发育时期所转录的mRNA经反转录形成的cDNA片段与某种载体连接而形成的克隆的集合。Collegeof...
为获得厚壳贻贝足腺组织的EST序列标签以及可能的功能基因序列,以pCMVsport6质粒为载体构建了高质量的厚壳贻贝足腺组织cDNA文库,文库滴度为1.31×107pfu/mL,重组率为98%,平均插入片段为1.3kb.通过对文库部分克隆的序列测定,获得了11个新基因和17个功能基因,其中包括部分与厚壳贻贝足丝相关的基因.厚壳贻足腺组织cD-...
全长cDNA文库ESTs采用SMART技术,构建了欧李(Prunus humilis Bunge)品系T8-1叶片全长cDNA文库,原始文库滴度达6.17×10~7 pfu/mL,库容达3.7×10~7,重组率达95%,平均插入片段大小约为1.2 kb.随机挑取400个单克隆进行5'端测序,共获得364个欧李ESTs.绝大部分ESTs的长度在500～1300 bp之间,平均长度为877 bp,其中...
芝麻全长cDNA文库的构建及序列分析
将这些EST测序,进行相关的功能注释,并以此为基础,对枣树的EST-SSR进行了发掘和特征分析,并对枣树核糖体蛋白家族及亲环素蛋白进行了相关的生物信息学分析。1、枣树cDNA文库EST的功能注释与分析:通过枣树生长初期结果枝DNA文库的部分筛选,获得了2633个阳性克隆,经酶切鉴定得到1061个cDNA插入片段。将867个长度在500bp...
首先,cDNA 文库构建是通过逆转录技术将细胞或组织中的mRNA 转化为cDNA,进 而构建出一个包含所有表达基因的文库,为后续研究提供基础。其次, 表达序列标签测序(EST 测序)是对cDNA 文库中的序列进行高通量 测序,以发现新的基因和蛋白质,并揭示基因的表达模式。 在野生冬虫夏草的cDNA 文库构建和表达序列标签测序方面,...