也可以使用conda进行安装 conda install-c bioconda cdhit 使用很简单,输入目标文件名和输出文件名以及一些简单的参数就像能运行。 cd-hit-est -i ./SRS7102777.Trinity -o ./SRS7102777_cd-hit-est.fasta -c 0.98a -d 0 -T 8 -M 64000 核苷酸序列使用cd-hit-est命令,氨基酸序列使用cd-hit命令。 -i 输...
最好应该是下面的命令: cdhit -i in.fasta -o out.fasta -d 30 -G 1 -M 16000 -T 20 -uL 0.05 -S 2 -U 2 -g 1 -aL 0.95 -aS 1 以上!
最好应该是下面的命令: cdhit -i in.fasta -o out.fasta -d 30 -G 1 -M 16000 -T 20 -uL 0.05 -S 2 -U 2 -g 1 -aL 0.95 -aS 1 以上!