研究人员使用RNA velocity分析了不同患者对GOLP治疗的反应,发现反应不同患者的CD8 GZMB+细胞群存在显著差异。对比反应良好和反应较差的患者后发现,反应良好的患者中CD8 GZMB+ TCR克隆扩增比例更高,衰竭评分更低,并且与适应性免疫应答相关的基因表达增加。相反,在反应较差的患者中,CD8 GZMB+细胞的特征基因与细胞因子信号...
实验结果表明,肿瘤细胞的存在可以刺激抗原特异性CD8+ T细胞IFNg(干扰素g)和GzmB(颗粒酶B)的产生,并改变CD8+ T细胞的代谢,但不影响Ki67这种细胞增殖标记物的表达。然而,肿瘤细胞培养24小时后获得的条件培养基(CM)中的营养条件以抗原独立的方式...
第三项研究中观察到的CD8+ T细胞状态和前两项研究类似,不过用了不同的命名,包括由CCR7、IL7R、LEF1和TCF7表达的“记忆”T细胞(相当于前两项研究中的“幼稚”/“幼稚样”T细胞),以及由FCGR3A、KLRG1、PRF1和GZMB表达定义的“细胞毒...
在与肿瘤细胞培养24小时后对T细胞的细胞毒性进行检测,发现肿瘤细胞的存在可以刺激抗原特异性CD8+T细胞IFNg和GzmB的产生并改变CD8+T细胞的代谢,但不能影响Ki67的表达。此外,模拟TME的条件培养基(CM)以独立于抗原的方式抑制CD8+T细胞的IFNg和GzmB的产生以及PC的活性,这表明由肿瘤细胞塑造的营养成分可以抑制CD8+T细胞的效...
过表达FOXO1后，T细胞自身攻击消失。与之前的的报道一致【4】，短链脂肪酸醋酸酯进一步增加了CXCR6+CD8 T细胞GzmB的表达，促进了TNF的释放。CD8 T细胞的自身攻击是如何实现的？尽管CXCR6+CD8 T细胞的PD1水平很高，但是抗PD1检查点抑制并未增强自身攻击，于是作者开始寻找以MHC非以来的方式触发的T细胞活化方式，胞外实验...
在CD8 T细胞中缺乏瘦素受体信号传导的情况下,肿瘤浸润性CD8中的CPT1B表达和FAO率降低T细胞,而CD8 T细胞中GAPDH和HK2以及IFNg和GzmB的表达水平增加,同时还伴随着p-Stat3水平的降低和肿瘤的生长。两者合计,我们发现源自脂肪细胞的瘦素激活肿瘤浸润的TEFF细胞中的STAT3,从而增加FAO并抑制糖酵解,这与TEFF细胞功能减弱和...
综上所述,这些结果表明,肿瘤细胞的存在可以刺激抗原特异性CD8+ T细胞IFNγ和GzmB的产生,改变CD8+ T细胞的代谢,但不能影响Ki67的表达。然而,CM以CD8+ T细胞独立的方式抑制CD8+ T细胞中IFNγ和GzmB的产生以及PC活性,表明肿瘤细胞形成的营养成分可以抑制CD8+ T细胞的效应功能,导致代谢重编程。
值得注意的是,在HGG TIL中GZMK+CD8+T细胞富集,经典的细胞毒性标志(如PRF1, GNLY和GZMB)在这些细胞中的表达不高。此外,还发现GZMK+T细胞在TIL中选择性扩增,但在匹配的PBMC中没有扩增。在其它类型的癌症中GZMK+T细胞的丰度也相对增加。这些结果表明,GZMK+T细胞可能代表了一种不同于正常耗竭T细胞的效应细胞亚群,也...
query.projected<-lapply(query.projected,function(x){cellstate.predict(ref=ref,query=x,reduction="umap",ndim=2)})query.projected.merged<-suppressMessages(Reduce(ProjecTILs:::merge.Seurat.embeddings,query.projected))genes<-c("Foxp3","Cd4","Cd8a","Tcf7","Ccr7","Sell","Il7r","Gzmb","Gzmk...
在这里,慢性激活评分是基于与T细胞功能障碍相关的基因,包括免疫检查点(HAVCR2、TIGIT、PDCD1、CTLA4、LAG3和ENTPD1)、效应基因(GZMB、IFNG和FASLG)以及转录因子TOX等72个基因。总的来说,慢性激活评分可以将细胞分为三种状态:效应,功能障碍和幼稚/记忆。