2024年9月19日,浙江大学徐骁、杭州市第一人民医院魏续勇和王帅共同通讯在Cellular & Molecular Immunology在线发表题为“Hepatocellular carcinoma-specific epigenetic checkpoints bidirectionally regulate the antitumor immunity of CD4+ T...
PD-1hiCD39+CD4 Tconv TILs包含肿瘤特异性细胞(Ag),并在PD-1阻断时对CD8 T细胞提供帮助 图5 PD-1hiCD39+CD4 Tconv TILs包含肿瘤特异性细胞,并通过增强DC介导的CD8 T细胞增殖来响应PD-1的阻断 作者将体外CD4 Tconv TILs分类为PD-...
(3)PD-1hiCD39+ CD4 Tconv TILs包含肿瘤特异性细胞(Ag),并在PD-1阻断时对CD8 T细胞提供帮助 图5 PD-1hiCD39+ CD4 Tconv TILs包含肿瘤特异性细胞,并通过增强DC介导的CD8 T细胞增殖来响应PD-1的阻断 作者将体外CD4 Tconv TILs分类为PD-1-CD39-、PD-1hiCD39-和PD-1hiCD39+亚群(图3A)并克隆。
基于GSE140228和TCGA数据,我们建立了CD4+Tconv相关基因和lncRNA共表达网络,并确定了3877个CD4+Tconv相关lncRNAs。 3.CD4+Tconv相关lncRNAs对HCC预后特征的构建和验证 我们从HCC的scRNAseq数据中获得了CD4+Tconv相关的基因,并确定了CD4+Tconv相关的lncRNAs进行进一步研究。基于TCGA-HCC数据,我们提取了与生存相关的lncRNA...
此外,在ChAT-GFP+Foxp3+ Treg细胞和ChAT-GFP+Foxp3–常规T(Tconv)细胞上出现了显著更高的Ki67表达,表明增殖是肝癌中表达ChAT的T细胞诱导的基础。HCC中诱导胆碱能Treg细胞和PD-1+CD4+T细胞。单细胞TCR-seq证明了肝癌中ChAT-GFP+ T细胞的TCR特异性扩增。使用OVA来模拟肿瘤抗原表明其能驱动胆碱能CD4+T细胞扩增。
此外,在ChAT-GFP+Foxp3+ Treg细胞和ChAT-GFP+Foxp3–常规T(Tconv)细胞上出现了显著更高的Ki67表达,表明增殖是肝癌中表达ChAT的T细胞诱导的基础。HCC中诱导胆碱能Treg细胞和PD-1+CD4+T细胞。单细胞TCR-seq证明了肝癌中ChAT-GFP+ T细胞的TCR特异性扩增。使用OVA来模拟肿瘤抗原表明其能驱动胆碱能CD4+T细胞扩增。
作者将体外CD4 Tconv TILs分类为PD-1-CD39-、PD-1hiCD39-和PD-1hiCD39+亚群(图3A)并克隆。在体外扩增的PD-1hiCD39-和PD-1hiCD39+亚群的克隆群体中,绝大部分保守了它们的体外表型(图5,A和B)。一部分来自分类后的PD-1-CD39-细胞的克隆获得了一定水平的PD-1和/或CD39表达(图5,A和B)。作者用覆...
图5 PD-1hiCD39+ CD4 Tconv TILs包含肿瘤特异性细胞,并通过增强DC介导的CD8 T细胞增殖来响应PD-1的阻断 作者将体外CD4 Tconv TILs分类为PD-1-CD39-、PD-1hiCD39-和PD-1hiCD39+亚群(图3A)并克隆。在体外扩增的PD-1hiCD39-和PD-1hiCD39+亚群的克隆群体中,绝大部分保守了它们的体外表型(图5,A和B...
此外,在ChAT-GFP+Foxp3+ Treg细胞和ChAT-GFP+Foxp3–常规T(Tconv)细胞上出现了显著更高的Ki67表达,表明增殖是肝癌中表达ChAT的T细胞诱导的基础。HCC中诱导胆碱能Treg细胞和PD-1+CD4+T细胞。单细胞TCR-seq证明了肝癌中ChAT-GFP+ T细胞的TCR特异性扩增。使用OVA来模拟肿瘤抗原表明其能驱动胆碱能CD4+T细胞扩增。
1,Pearson算法计算CD4+ Tconv相关lncRNA和基因的相关性; 2,LASSO,单因素COX,多因素COX用来构建预后模型; 3,Survival和rms包用来构建列线图; 4,clusterProfiler 包用于进行GO和KEGG富集分析; 5,GSEA用于高低风险组的富集分析; 6,TIMER2.0用来分析高低风险组之间的免疫细胞的浸润; ...