Short name The short name of a conserved domain, which concisely defines the domain. For example, "Voltage gated ClC" is the short title of the NCBI-curated conserved domain model for the voltage gated chloride channel (cd00400). Incomplete If the hit to a conserved domain is partial (i.e...
CD(Conserved Domain)是NCBI提供的一种用于查找保守结构域的工具。 CD-Search 的主要功能包括: Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 结构域注...
1.CDD⼊⼝：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/，该⼯具为NCBI提供的，NCBI主页选项⼝选择进⼊Conserved Domain然后点击Search。然后选择CD-search（单个基因），或者Batch CD-Search（多个基因）。attachments-2018-07-HXZXbUUl5b55498230963.jpg 2.预测单条序列的保守结构域，点击CD-search进⼊：粘贴基因...
由于基础知识薄弱,利用NCBI中的conserved domain search 工具分析一蛋白序列结果后,对显示的结果看不大明白。向各位求教,谢谢! 图中specific hits中为什么右边是锯齿形状呢,还有这图形颜色有什么含义吗?有锯齿是说明我的序列不完整嘛?如图一 有的结果在non-specific hits中也有匹配到的结果,这应该怎么解读呢 如图二 ...
Results: Here we report synthaser, a Python package leveraging the NCBI's conserved domain search tool for remote prediction and classification of fungal megasynth(et)ase domain architectures. Synthaser is capable of batch sequence analysis, and produces rich textual output and interactive ...
1.CDD入口:https://www.ncbi.nlm./cdd/,该工具为NCBI提供的,NCBI主页选项口选择进入Conserved Domain然后点击Search。 然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进入: 粘贴基因的蛋白序列,或者是核酸序列都可以,注意为fasta序列,如果你知道基因的GI...
CD-Search是NCBI提供的一项服务,主要用于查找保守结构域。这个工具的核心功能包括: 1. Conserved Domain Database (CDD):CD-Search基于NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含了已知的结构域数据库。 2. 结构域识别:用户可以提交蛋白质序列,CD-Search将对序列进行分析,识别其中的保守结构域。
1.CDD入口:https://www.ncbi.nlm./cdd/,该工具为NCBI提供的,NCBI主页选项口选择进入Conserved Domain然后点击Search。 然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进入: 粘贴基因的蛋白序列,或者是核酸序列都可以,注意为fasta序列,如果你知道基因的GI...
1. 使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体我们可以进入NCBI后选择Conserved Domain然后点击Search。 出现如下界面,黄色部分即是本次要讲的工具。其中CD-search只能提交单条序列,Batch CD-Search可以上传多条序列。
Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 结构域注释: 工具提供有关查询序列中结构域的信息,包括结构域的名称、位置以及与数据库中其他蛋白质的相...