1.CDD入口:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/,该工具为NCBI提供的,NCBI主页选项口选择进入Conserved Domain然后点击Search。 然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进入: 粘贴基因的蛋白序列,或者是核酸序列都可以,注意为fasta序列,如果你知道基...
1. 使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体我们可以进入NCBI后选择Conserved Domain然后点击Search。 出现如下界面,黄色部分即是本次要讲的工具。其中CD-search只能提交单条序列,Batch CD-Search可以上传多条序列。 2. 我们先以CD-Search为例,预测单条序列的结...
CD(Conserved Domain)是NCBI提供的一种用于查找保守结构域的工具。 CD-Search 的主要功能包括: Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 结构域注...
1.CDD⼊⼝:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/,该⼯具为NCBI提供的,NCBI主页选项⼝选择进⼊Conserved Domain然后点击Search。然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。attachments-2018-07-HXZXbUUl5b55498230963.jpg 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进⼊:粘贴基因...
1、首先打开设备,并启动cdsearch工具。2、其次点击右下角个人中心。3、最后点开全部文件即可查看。结果是一个汉语词汇,读音为jiēguǒ&、jiéguǒ,本指植物长出果实。
使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体可以进入NCBI后选择Conserved Domain然后点击Search。搜索结果中有四种类型的匹配:特定匹配(specific hits),非特定匹配(non-specific hits),这些匹配所属的超家族(superfamily),以及多结构域(multi-domains)...
预测蛋白质结构域(Conserved Domains)在线分析工具:◆ NCBI Conserved Domains:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/...
aSearch Tool: Open the CD, click,The Search Tool will run automatically.( No need to install. You can copy this software to your desktop.) 查寻工具: 打开CD,点击,查寻工具将自动地跑。(没有需要设施。 您能复制这软件到您的桌面。)[translate]...
qdrant_indexer实现了用于索引操作的/index端和用于搜索操作的/search端。操作都是基于嵌入向量的,不关注...
ncbi CD search结果解读由于基础知识薄弱,利用NCBI中的conserved domain search 工具分析一蛋白序列结果后,对显示的结果看不大明白。向各位求教,谢谢! 图中specific hits中为什么右边是锯齿形状呢,还有这图形颜色有什么含义吗?有锯齿是说明我的序列不完整嘛?如图一 有的结果在non-specific hits中也有匹配到的结果,这应...