目前,没有数据库从微生物组MAG中收集CAZymes和CAZyme基因簇(CGC)并在网络上提供它们。 ✦CAZyme研究对人体健康非常重要 与此同时,CAZyme生物信息学领域继续发展。现在可以推断CAZymes和CGCs的碳水化合物底物,这对应用微生物组非常有兴趣。例如,基于微生物组的个性化营养旨在使用个性化饮食干预策略来调节人体肠道微...
dbCAN-seq数据库，专为CAZyme研究而设计，已迎来重要更新。CAZymes，这类酶专注于碳水化合物的降解、合成和修饰，对人类健康、微生物组生态及全球碳循环等领域至关重要。过去五年，微生物组测序的大量数据促使数据库如MGnify和IMG/M提供了丰富资源。然而，dbCAN-seq数据库在微生物组MAG中的CAZymes和CG...
标题:dbCAN-seq: a database of carbohydrate-active enzyme (CAZyme) sequence and annotation 中文:碳水化合物酶序列注释数据库dbcan-seq 杂志:Nucleic Acids Research 时间:2018 单位:北伊利诺斯大学,南开大学 meta server:http://bcb.unl.edu/dbCAN2/ ...
与其他在线CAZyme和PUL资源相比,dbCAN-PUL具有以下新特点:(1)通过靶底物、种/基因组、属或实验表征方法批量下载PUL数据;为每个普尔(ii)注释显示关联的元数据,如基质(s),实验表征方法(s)和蛋白质序列信息,(3)外部链接注释页CAZymes (CAZy)转运蛋白(UniProt)和其他基因,(iv)显示基因库同源基因簇的序列通过集成Mu...
dbCAN-seq数据库于2018年发布,提供了5349株细菌分离株基因组的CAZyme和CGC (CAZyme基因簇)序列及注释数据。 CGC是研究人员定义的一个术语,用于描述微生物基因组中含有CAZyme的基因簇。 PUL指多糖利用位点,是一个更流行的术语,描述利用复杂碳水化合...
dbCAN-seq数据库于2018年发布,提供了5349株细菌分离株基因组的CAZyme和CGC (CAZyme基因簇)序列及注释数据。 CGC是研究人员定义的一个术语,用于描述微生物基因组中含有CAZyme的基因簇。 PUL指多糖利用位点,是一个更流行的术语,描述利用复杂碳水化合物底物的基因簇,例如XUL(木聚糖利用位点),ChiUL(几丁质利用位点)和...
dbCAN-seq数据库于2018年发布,提供了5349株细菌分离株基因组的CAZyme和CGC (CAZyme基因簇)序列及注释数据。 CGC是研究人员定义的一个术语,用于描述微生物基因组中含有CAZyme的基因簇。 PUL指多糖利用位点,是一个更流行的术语,描述利用复杂碳水化合物底物的基因簇,例如XUL(木聚糖利用位点),ChiUL(几丁质利用位点)和...
dbCAN-seq数据库于2018年发布,提供了5349株细菌分离株基因组的CAZyme和CGC (CAZyme基因簇)序列及注释数据。 CGC是研究人员定义的一个术语,用于描述微生物基因组中含有CAZyme的基因簇。 PUL指多糖利用位点,是一个更流行的术语,描述利用复杂碳水化合物底物的基因簇,例如XUL(木聚糖利用位点),ChiUL(几丁质利用位点)和...
dbCAN-seq数据库于2018年发布,提供了5349株细菌分离株基因组的CAZyme和CGC (CAZyme基因簇)序列及注释数据。 CGC是研究人员定义的一个术语,用于描述微生物基因组中含有CAZyme的基因簇。 PUL指多糖利用位点,是一个更流行的术语,描述利用复杂碳水化合物底物的基因簇,例如XUL(木聚糖利用位点),ChiUL(几丁质利用位点)和...
dbCAN-seq数据库于2018年发布,提供了5349株细菌分离株基因组的CAZyme和CGC (CAZyme基因簇)序列及注释数据。 CGC是研究人员定义的一个术语,用于描述微生物基因组中含有CAZyme的基因簇。 PUL指多糖利用位点,是一个更流行的术语,描述利用复杂碳水化合物底物的基因簇,例如XUL(木聚糖利用位点),ChiUL(几丁质利用位点)和...