在大肠杆菌中进行的PAM识别实验中,Cas-SF01 倾向于识别多种PAM,包括TTN、ATN、NATN和TTVN,这些结果说明Cas-SF01 具有较高的编辑效率和更宽的PAM 识别范围(图3)。 图3. Cas-SF01具有较高的编辑效率和较宽的PAM范围 A. 在EGxxFP报告子系统中,Cas-SF01表现出比野生型Cas12i3、Cas12iHiFi和hf
研究团队评估了Cas-SF01 编辑内源基因的性能,与野生型Cas12i3 相比,Cas-SF01产生Indel 突变的活性增加了约3倍。EgxxFP 报告系统中显示Cas-SF01 的平均编辑效率为88%,高于其他Cas核酸酶。在PCSK9、TTR和CCR5 基因的外显子上设计的40多个靶点上,Cas-SF01 的平均编辑效率约为80%,超过了hfCas12Max,AsCas12a...
结合LNP脂质体递送系统,通过体内靶向小鼠的Ttr基因,Cas-SF01实现了与Cas9媲美的编辑效率。在单子叶植物水稻多位点的稳定转化株系中,优化版本Cas-SF01能显著提高编辑效率,达到75%左右。在双子叶植物辣椒和大豆发根系统中,自然版本的Cas12i3未能检测到编辑事件,而Cas-SF01则表现出50%左右的编辑效率。以上数据表明Cas...
改进CRISPR/Cas12i变体Cas-SF01提高基因编辑工具效率 基于LAMP扩增技术的弧菌快速检测方法的建立 美格生物部分热销试剂价格
相较于Cas9,这些新发现的Cas蛋白普遍存在效率低,识别范围小等缺点,限制了其进一步应用。南方科技大学朱健康院士团队开发了一种基于AI预测Cas蛋白与核酸互作的位点,通过理性设计获得了在动植物体内媲美Cas9活性版本的Cas-SF01, 为疾病治疗和动植物基因编辑提供高效新工具。
本文综述了人工智能(artificial intelligence, AI)技术在CRISPR-Cas系统设计、挖掘与改造中的应用进展。AI技术,特别是机器学习,通过分析高通量测序数据,优化sgRNA设计、提升编辑效率、预测脱靶效应。本文讨论了AI在单链引导RNA (single guide RNA, ...
媲美Cas9活性的新型基因编辑工具Cas-SF01 _ 基于Cas9祖先蛋白的迷你型基因编辑器 _ CRISPR/Cas9体系编辑线粒体DNA的直接证据 _ Treg核心转录因子FOXP3识别与结合DNA的新模式 _ 大规模宏基因组数据集上的抗生素耐药性基因(ARG)富集图谱和新功能发现 _
Cas-SF01具有较高的编辑效率和较宽的PAM范围 研究团队选择S7R、N168R、D233R 和T235R 以及N168Y 和G169W 进行组合鉴定,通过逐步测定确定了变体组合(Cas12i3-S7R/D233R/D267R/N369R/S433R)并命名为Cas-SF01。研究团队评估了Cas-SF01 编辑内源基因的性能,与野生型Cas12i3 相比,Cas-SF01产生Indel 突...
Cas-SF01具有较高的编辑效率和较宽的PAM范围 研究团队选择S7R、N168R、D233R 和T235R 以及N168Y 和G169W 进行组合鉴定,通过逐步测定确定了变体组合(Cas12i3-S7R/D233R/D267R/N369R/S433R)并命名为Cas-SF01。研究团队评估了Cas-SF01 编辑内源基因的性能,与野生型Cas12i3 相比,Cas-SF01产生Indel 突...
该研究基于Cas蛋白结构的理性设计,将PAM,DNA底物及gRNA区域的氨基酸残基进行精氨酸突变,简单快捷的实现Cas蛋白改造。利用这一方法,我们获得了在动植物体内高活性的Cas-SF01,为未来的动植物基因编辑和基因治疗提供高效平台。 责任编辑 王启钦 暨南大学 王天帅 西北工业大学 ...