研究结果显示,CASZ1b亚型在T-ALL细胞系和患者样本中显著上调。此外,实验数据表明,TAL1的过表达或低表达分别导致CASZ1b的上调或下调,暗示TAL1可能直接调控CASZ1b的表达。通过进一步的实验,研究团队发现TAL1能够直接结合到CASZ1b的启动子区域,从而加强了TAL1与CASZ1在T-ALL中的正相关性(图1)。 图1 CASZ1在...
进一步,课题组利用Casπ系统对HEK293A细胞系基因组中插入的移码突变GFP报道系统位点 (out-of-frame EGFP cell line) 和内源基因位点进行编辑操作,并利用深度测序,分析和评估了编辑结果。结果表明,还未经改造优化的Casπ可对真核生物基因组产生有效编辑,与LbCas12a效率相当,最高可达到SpyCas9编辑效率的一半(图2)。
研究团队使用CRISPR-Cas13靶向编辑RNA,系统性分析了5种人类细胞系(包括肾、白血病和乳腺癌细胞)中近6200个lncRNA。为了找出必需lncRNA的名单,研究团队利用CRISPR逐个扰乱或敲除这些lncRNA,并观察当每个lncRNA失效后细胞的生存状态。 结果,研究...
1.天津医科大学基础医学院生化系、天津市免疫学研究所张恒团队与中国科学院武汉病毒研究所邓增钦团队在Nature期刊发表了关于新型CRISPR/Cas系统的分子功能机制的研究论文。 2.该研究发现,VII型CRISPR复合体对核酸酶(Cas14)的招募依赖于底物RNA与crRNA序列的互补配对。 3.通过细胞功能实验,证实这一复合体能够序列特异性...
细胞培养检测 Pluronic F-127上海齐源生物科技有限公司 产品详细介绍:齐源生物现货产品:PluronicF-127细胞培养检测规格:10g储存条件:室内储存不要冷冻保质期:12个月现货产品物理化学光谱特性分子量 12500溶剂:DMSO现货产品介绍PluronicF-127是一种非离子表面活性剂,100%活性,对低浓度细胞无毒,常用于染料AM酯,如Indo-...
进一步,课题组利用Casπ系统对HEK293A细胞系基因组中插入的移码突变GFP报道系统位点 (out-of-frame EGFP cell line) 和内源基因位点进行编辑操作,并利用深度测序,分析和评估了编辑结果。结果表明,还未经改造优化的Casπ可对真核生物基因组产生有效编辑,与LbCas12a效率相当,最高可达到SpyCas9编辑效率的一半(图2)。
基于我们课题组和其他课题组的ZFN和TALENs的靶向效率的实验,我们在细胞系水平上进行了比较,虽然他们可能与不同的突变特征有关。Chen的课题组的最近的研究进行了大规模的体外分析,发现TALENs在使用与上下游相关的序列的时候比ZFNs显著的具有更多的突变产生。另一个组比较了TALENs和CRISPRs在人类ESCs细胞中的情况,观察到...
接着诱导Cas1、Cas2表达30分钟,并将培养物转移到30摄氏度,使复制同步开始。在这些条件下,复制叉在dnaC2细胞中完成一个完整的DNA复制周期平均需要60分钟左右,在同步复制启动后的20、40、60、90和120分钟对新获得的间隔序列进行了测序,发现随着复制周期的推进,来自Ter区的间隔片段的比例逐渐增加,在60分钟时到达顶峰...
通过对靶标位点的特异性识别,结合细胞自身的DNA修复功能或转录调控机制,CRISPR-Cas系统可高效编辑靶标序列或精准调控基因的表达,目前已被开发成为基因编辑领域的有力工具。根据效应复合物组成形式的不同,CRISPR-Cas系统分为1类(Ⅰ型、Ⅳ...
以前,在使用老版本的工具时,我们只能在干细胞中实现10%的编辑,在癌症来源的细胞系中可能实现30%到50%的编辑。 这个团队现在开发了Neisseria lactamicaCRISPR-Cas3纯化了Cascade RNP和Cas3蛋白,在干细胞中可以达到50%的编辑效率,在其他人类细胞系中可以达到95%的编辑效率。为了最大限度地利用这个工具,他们开始建立一...