原文链接:CARD数据库简介及使用方法 欢迎关注“细猪技术”微信公众号,更早获取最新资讯 Comprehensive Antibiotic Resistance Database(CARD)数据库(card.mcmaster.ca/)是由抗生素耐药性本体论(ARO)和抗菌素耐药性基因检测模型组织的一个严格整理的具有特征的同行评议的耐药决定因素和相关抗生素的
目录 收起 1.card网站介绍 2.card数据库下载 2.1 下载 2.2 blast比对 网址:The Comprehensive Antibiotic Resistance Database 介绍:CARD,综合抗生素耐药性数据库,提供了与抗生素耐药性分子基础相关的数据、模型和算法,用于抗生素耐药性研究。 1.card网站介绍 BLAST:使用blast于数据库进行比对 RGI main:Resistance ...
基因组CARD数据库(抗药性基因数据库)在这一领域中的重要性不言而喻它为我们提供了关于抗药性基因的注释帮助我们理解这些基因是如何在微生物中出现、传播。甚至进化的。抗药性基因是一种基因组变异得特殊类型已成为全球公共卫生领域日益关注的焦点。这些基因赋予病原体对抗生素的抗性,致使治疗细菌感染变得更加困难。过去...
1. 打开Card数据库客户端工具,连接到目标数据库。 2. 在工具栏或菜单中选择“新建数据库”选项。 3. 输入数据库名称和描述信息,并选择合适的存储引擎。 4. 点击“确定”按钮,等待数据库创建完成。 四、创建卡片表 1. 在数据库中创建新的表格,用于存储卡片信息。 2. 定义表格的字段,包括卡片编号、卡片类型、...
在CARD数据库网站,点击Analyze选项可进入耐药基因预测界面。耐药基因预测分析可通过选择BLAST和RGI(Resistance Gene Identifier)两种模式来实现。BLAST是依赖NCBI中BLAST软件,将序列与CARD参考序列进行比对,获得相关的注释信息; RGI是CARD数据库团队开发的基于蛋白预测抗性基因序列的软件,即通过蛋白同源和蛋白变异来预测抗性基因...
CARD数据库(http://arpcard.mcmaster.ca)核心是ARO(Antibiotic Resistance Ontology), ARO包含了与抗生素抗性基因,抗性机制,抗生素和靶相关的term,如图所示。2017年发表的文章中,更新了数据库的相关功能,其中也提到了其他本体论,如用于描述抗生素抗性基因预测模块和参数的MO,定义不同term之间关系类型的RO,以及描述CARD中...
CARD (The Comprehensive Antibiotic Resistance Database) CARD是抗性基因数据库,是一个集合了抗药基因包括抗生素的数据库。通过序列同源性的比对就可以得到相应的抗性基因注释结果,能够看到基因的抗性类型、机制等信息。同时该数据库还提供画图功能,高效实用。 网址: https://card.mcmaster.ca/ annoation ...
中国审计与风险数据库-CARD 1 数据库简介 中国审计与风险数据库(Chinese Audit and Risk Database, CARD)是基于对中国公司审计与风险的深入考察和了解,建立的详细、准确和全面的公司审计与风险研究专业数据库。该库不仅包括中国注册会计师的个人特征和会计师事务所的基本信息,涵盖了这些事务所对上市公司出具的审计意见...
Features of CARD include:BLAST: A tool for database alignment comparisons.RGI main: This tool predicts resistance using protein or nucleotide data.Online prediction: Accessible through The Comprehensive Antibiotic Resistance Database.Command line: Available on GitHub, at arpcard/rgi.Download ...
GeneCards基本覆盖了几大数据库对于基因的分析数据,是人类基因的综合数据库。 GeneCards提供简明的基因组,蛋白质组,转录,遗传和功能上所有已知和预测的人类基因。 GeneCards中的信息功能信息包括指向疾病的关系,突变和多态性,基因表达,基因功能,途径,蛋白质与蛋白质相互作用,相关的药物及化合物和切割等先进的研究抗体的...