CAGE-seq,即加帽端mRNA测序,主要是鉴定转录起始位点(TSS)。绝大多数基因有两个甚至两个以上的转录起始位点,不同的转录起始位点会导致基因受到不同的上游非翻译区的调控作用(5'UTR)。不同的5'UTR序列中可能包含截然不同的作用元件,不同的起始位点导致了基因的表达所响应的信号也完全不同。同一个基因有可能受不...
链接接头,测序需要两种接头,其中一种接头被设计为链接有羟基暴露的磷酸,另一种则连接正常序列,因此只有原来受“帽子”保护的5'端序列才能同时结合两种接头,通过测序得到序列信息。 再将得到的CAGE序列比对到参考基因上,就可以得到转录起始位点和相应的5'UTR信息啦 现在CAGE-seq进一步发展,可以使用氧化反应或生物素进行...