KEGG核糖体通路等是化合物m-Se3处理后最显著富集的下调基因组。图10 m-Se3抑制c-MYC转录阻断癌细胞生长并调控广泛基因网络——体内活性评价—— m-Se3抑制小鼠异种移植模型中肿瘤的生长研究者使用人肝癌异种移植小鼠模型评估化合物于体内的抗肿瘤作用。实验结...
为了探究PFKP促进肿瘤发展的机制,使用PFKP敲低的细胞和对照组进行了转录组分析,共筛选出2019个差异基因,其中906个上调,1113个下调(图1A)。差异基因的KEGG富集分析发现,MAPK途径是PFKP抑制后显著改变的途径之一(图1B),ERK途径是所有MAPK信号转导途径中最重要的信号级联,在肿瘤细胞的生存和发展中起着至关重要的作用。
为了探究PFKP促进肿瘤发展的机制,使用PFKP敲低的细胞和对照组进行了转录组分析,共筛选出2019个差异基因,其中906个上调,1113个下调(图1A)。差异基因的KEGG富集分析发现,MAPK途径是PFKP抑制后显著改变的途径之一(图1B),ERK途径是所有MAPK信号转导途径中最重要的信号级联,在肿瘤细胞的生存和发展中起着至关重要的作用。
随后,对2组差异代谢物的富集情况进行了KEGG、MetPA、MSEA分析。如图4所示,在负离子模式下,差异代谢物KEGG分析显示,代谢途径富集到的差异代谢物数目最多;MetPA分析显示,柠檬酸循环、丙酮酸代谢、磷酸戊糖途径、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代...
如图4所示,在负离子模式下,差异代谢物KEGG分析显示,代谢途径富集到的差异代谢物数目最多;MetPA分析显示,柠檬酸循环、丙酮酸代谢、磷酸戊糖途径、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢、乙醛酸和二羧酸代谢等代谢途径在代谢网络中较为重要;MSEA分析未发现与糖代谢相关的代谢途径富集。在正离子模式下,KEGG分析未富集到与糖代谢...
差异表达mRNA的KEGG通路分析显示糖酵解有相当大的富集(图2B)。对转录组数据进行的GSEA显示,METTL5大大增加了MYC信号通路和糖酵解信号通路。因此,对TCGA数据库的GSEA分析显示METTL5与MYC信号通路之间存在正相关。此外,作者采用基于高效液相色谱-串联质谱的非靶向代谢组学方法检测代谢物。METTL5-KO细胞的代谢组与METTL5...
GO 富集分析和 KEGG 通路分析结果显示,FAK 通路在转录组和蛋白质组数据中均显著富集,且参与小鼠 CCl4 诱导的肝纤维化过程。转录组分析还发现 FAK 通路中细胞周期蛋白 D1(cyclin D1)蛋白表达上调,Western blotting 验证了 MCT - 1、cyclin D1 和 c - myc 在 CCl4 诱导的肝纤维化小鼠中的表达上调,提示 ...
KEGG pathway analyses were conducted to investigate NAT10-related pathways in NSCLC. The influence of NAT10 on cell cycle was assessed by flow cytometry and cell synchronization assay. The association between c-myc and NAT10 promoter was determined by ChIP. Compared with normal tissue, NAT10 was...
c:c-Myc阳性和阴性(+/-)调节基因的KEGG和基因本体论(GO)分析。红圈: 上调通路,蓝圈:下调通路。圆圈中的数字:基因数量。 d:OV qNSC v qNSC和KD aNSC v aNSC中细胞周期基因的表达模式。 图6显示了NSC静息和激活期间的线粒体重塑。 a:在激活的NSCs(n=20)和静息的NSCs(n=31)中量化线粒体大小。散点图...
AVolcano plot of the DEGs from the transcriptomes of the control and anlotinib group (P < 0.05, Fold change > 1.5).BKEGG analysis of the DEGs.CNCI-H929 and RPMI-8226 cells were treated with anlotinib (5 μM) for the indicated time. Whole cell lysates were subjected to weste...