C-index的计算⽅法是把所研究的资料中的所有研究对象随机地两两组成对⼦,以⽣存分析为例,两个病⼈如果⽣存时间较长的⼀位其预测⽣存时间长于另⼀位,或预测的⽣存概率⾼的⼀位的⽣存时间长于另⼀位,则称之为预测结果与实际结果相符,称之为⼀致。
其中C为C-index的补数,C-index=1-C=1-0.366=0.634,或者也可以采用C-index=a(Dxy)/2+0.5=0.634来计算。 04 结果解读 本例中,4种计算方法得到的C-index 都为0.634,处于0.50-0.70之间,表明预测模型的准确度较低。 第三部分:总结 1) C-ind...
3、计算剩下的配对中,预测结果和实际相一致的配对数记为K,即(两个病人如果生存时间较长的一位其预测生存时间长于另一位,或预测的生存概率高的一位的生存时间长于另一位,则称之为预测结果与实际结果相符,称之为一致) 4、结果:计算C-index=K/M。 C-index...
surv=T),X1=cph(Surv(time,status)~x1,data=dat,x=TRUE,y=TRUE,surv=T),X2=cph(Surv(time,status)~x2,data=dat,x=TRUE,y=TRUE,surv=T))# time-cindex 计算times<-c(1,3,5,7,10)cindex<-cindex(models,formula=Surv(time,status)~1,eval.times=times,data=dat)plot(cindex)...
C-index,英文名全称concordance index,中文里有人翻译成一致性指数,最早是由范德堡大学(Vanderbilt University)生物统计教教授Frank E Harrell Jr 1996年提出,主要用于计算生存分析中的COX模型预测值与真实之间的区分度,常用在评价患者预后模型的预测精度中。
01 C-statistics&C-index计算 C-statistics即为C统计量是ROC曲线下面积。如果这个logistic回归用于预测或诊断,roc曲线下面积可以估计用logistic回归模型进行诊断或预测的能力。 Logistic回归模型根据预测概率绘制ROC曲线,其曲线下面积AUC = C-Statistics C-index,即一致性指数(index of concordance),通过评估模型预测结果...
生存模型的time C-index 计算与绘图 大神一句话,菜鸟跑半年。我不是大神,但我可以缩短你走弯路的半年~ 就像歌儿唱的那样,如果你不知道该往哪儿走,就留在这学点生信好不好~ 这里有豆豆和花花的学习历程,从新手到进阶,生信路上有你有我! 0.Time C-index...
C-index作为衡量预测模型区分度的关键指标，源于Frank E Harrell Jr于1996年提出。主要应用于生存分析，特别是评估肿瘤患者的预后模型预测精度。C-index通过比较预测值与实际值，评估模型预测精度，其计算方法基于随机配对病患数据。分数范围在0.5至1之间，1表示预测与实际完全一致，0.5表示完全不一致，模型...
计算C指数: install.packages("Hmisc") library(Hmisc) Cindex <- rcorrcens(mydata$disease~predict(mylog)) C统计量=0.919,SD=0.04, 计算C统计量SE的公式为SE=SD/2, 进一步计算C统计量95%可信区间的上限ul和下限dl。 结果显示,C统计量=0.919,95%可信区间为0.880-0.958©...
C-indexC-statistic计算的5种不同方法及比较 评价一个预测模型的表现可以从三方面来度量: 1.区分能力(discrimination): 指的是模型区分有病/没病,死亡/活着等结局的预测能力。简单举个例子,比如说,现有100个人,50个有病,50个健康;你用预测模型预测出46个有病,54个没病。那么这46个覆盖到50个真正有病的人的...