根据Dxy计算:c-index=Dxy/2+0.5=0.472/2+0.5=0.736 3.3 方法三,利用Hmisc包中rcorrcens()函数计算 rcorrcens(Surv(time,status)~predict(cox2), data=veteran) rcorrcens(Surv(time,status)~predict(cox1), data=veteran) ## ## Somers' Rank Correlation for Censored Data Response variable:Surv(time,...
理论上,C-index取值范围是[0.5-1]:Cindex=0.5表示预测与实际完全不一致,说明该模型没有预测作用;C-index=1表示该模型预测结果与实际完全一致。一般情况下C-index在0.50~0.70为准确度较低;在0.71~0.90之间为准确度中等;而高于0.90则为高准确度。 ...
library(stringr) library(survival) library(survminer) proj <- "ttt" load('data.Rdata') # TCGA-HNSC数据 2.数据预处理 colnames(meta) variables <- c("cluster", "gender", "neoadjuvant") meta <- cbind(meta[,c(1:3)], meta[,c("cluster", "gender", "neoadjuvant")]) data <- meta d...
有关Cox回归模型C-Index常用计算方法有如下两种。 (1)方法1:直接从survival包的函数coxph()结果中输出,需要R的版本高于2.15.要提前安装survival包可以看出这种方法输出了C-Index (对应模型参数C),也输出了标准误,95%可信区间就可以通过...
R软件实现: C-index的R软件计算实现有两种实现方法,一种是用到Harrell本人的的R包Hmisc package;另一种是Le Kang, Weijie Chen 2014年12月18日发布的R compareCPackage; ### ### Method 1.Hmisc code ### ### data <- read.csv("survivaldta.csv...
r语言cindex函数r语言cindex函数 R语言中,cindex()函数用于计算C-index或一致性指数(Concordance index)。 该函数的语法为: ``` cindex(y, pred) ``` 其中,参数y是一个向量,表示真实的生存数据(生存时间和生存状态),pred是一个向量,表示预测的生存概率。 例如,假设有以下5个样本的真实数据和预测概率: ``...
R语言潜类别分析 r语言cindex roc曲线和cindex曲线属于一致性的指标。后台有粉丝问怎么绘制cox回归中的时间相关性roc曲线和时间相关性cindex曲线,今天来演示一下。 我们先导入数据和R包 AI检测代码解析 library(survival) library("survminer") library(foreign)...
请问如何在R语言中计算C-index？c指数即一致性指数（index of concordance），用来评价模型的预测能力。c...
R软件实现: C-index的R软件计算实现有两种实现方法,一种是用到Harrell本人的的R包Hmisc package;另一种是Le Kang, Weijie Chen 2014年12月18日发布的R compareCPackage; ### ### Method 1.Hmisc code ### ### data <- read.csv("survivaldta.csv...
rcorr.cens的代码及结果，第一个值就是C指数，同时也有Dxy的值 rcorr.cens(sample.data$age, Surv(sample.data$os, sample.data$death))C Index Dxy S.D. n missing 4.528492e-01 -9.430156e-02 5.565299e-02 2.000000e+02 0.000000e+00 uncensored Relevant P...