在C语言中读取HDF5数据集时,如果遇到数据类型未知的情况,可以采用以下步骤来处理: 基础概念 HDF5(Hierarchical Data Format version 5)是一种用于存储大量数据的文件格式,支持多种数据类型和结构。HDF5文件中的数据集(Dataset)可以包含不同类型的数据,如整数、浮点数、字符串等。
#include <Eigen/Dense>#include "netcdfcpp.h"#include "hdf5.h"#include "H5Cpp.h"intread(Eigen::VectorXd &vd,constchar *file_path,constchar *g_name,constchar *d_name){//获取文件H5::H5File file(file_path, H5F_ACC_RDONLY);//获取组H5::Group group = file.openGroup(g_name);//获...
只读取可变长度数组的长度,而不读取hdf5中的元素。 、、、 我有一个包含Nvl 的数组,该数组已经写入hdf5文件。我可以通过c++读取整个数据(下面的片段在hdf5中,但使用C版本的hdf5 API的答案也同样受欢迎)dset.read(vl, VarLenType(&PredType:NATIVE_INT)); 但是,如果我只想读取每个可变长度对象的长度,即vl[i]....
c++读取netcdf 一维数据 读取维度例子 highlighter- PHP #include <Eigen/Dense>#include "netcdfcpp.h"#include "hdf5.h"#include "H5Cpp.h"NcFile dataFile(path, NcFile::read);NcVar latitude = dataFile.getVar("latitude");//获取维度大小std::vector<NcDim> latdims = latitude.getDims();intlatnu...
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实现股票数据的读取存储 我们的数据大部分存在于文件当中,所以pandas会支持复杂的IO操作,pandas的API支持众多的文件格式,如CSV、SQL、XLS、JSON、HDF5。 注:最常用的HDF5和CSV文件 1 CSV 1.1 read_csv pandas.read_csv(filepath_or_buffer, sep =’,’ ) ...
首先建立一个基于MFC 的对话框程序,工程名称为“CreateHDF5”。对话框界面如下: 在上述界面中,点击“HDF5输出路径”后弹出“另存为”对话框,我们可以选择生成的HDF5文件名称已经保存路径。设置好路径后点击“生成”按钮,会生成我们想要的HDF5 文件。为了保持文章的完整性,简要叙述相关控件及函数: 1、编辑框控件ID为...
h5py是hdf5文件库留给python的接口,这个配置类似于pyhdf。可以从这里进行下载,同样需要注意版本问题。更多的测试example和使用方法可以访问这里http://code.google.com/p/h5py/wiki/HowTo#Examples_in_the_source_distribution 这是python中读取hdf4和hdf5的基础功能,开始想使用gdal来完成读取配置的,但是可能是gdal版本...
HDF5文件是以类似于文件系统的分层结构组织的。它由组、数据集和属性组成。组和数据集类似于目录和文件,属性是键值对。一个.cool文件包括四个组:染色体、二元组、像素和索引。每个组用作表格,其中等长数组类型的数据集被用作字段。像素组包含了稀疏矩阵表中的接触矩阵,而二元组存储了二元组的基因组坐标和染色体组...
sudo yum install hdf5 hdf5-devel 并相应地设置环境变量：export HDF5_HOME=/usr export LD_LIBRARY_...